sphingopyxis granuli株TFAにおけるテトラリン分解遺伝子の異化代謝産物抑制に関与する低分子非コードRNA,SUHB【JST・京大機械翻訳】

Garcia-Romero Inmaculada; Forstner Konrad U.; Santero Eduardo; Floriano Belen

文献

J-GLOBAL ID：201802277297848594 整理番号：18A1911271

sphingopyxis granuli株TFAにおけるテトラリン分解遺伝子の異化代謝産物抑制に関与する低分子非コードRNA,SUHB【JST・京大機械翻訳】

SuhB, a small non-coding RNA involved in catabolite repression of tetralin degradation genes in Sphingopyxis granuli strain TFA

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巻： 20 号： 10 ページ： 3671-3683 発行年： 2018年
JST資料番号： W2561A ISSN： 1462-2912 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

Inferalソフトウェアを用いたin silicoアノテーションと組み合わせた転写開始部位の全体的dRNA-seq分析は,異なる炭素源上で増殖したSphingopopy granuli TFA細胞における91の推定非コードsRNAの発現を明らかにした。ハウスキーピングsRNAを除いて,Rfam suhBファミリー(RF00519)に属する1つの付加的sRNAのみがInfernalにより検出されたが,実験結果によると不正確なサイズであった。SuhBはSphingopyxis属を通して高度に保存されている。発現データは,suhBが急速に成長するTFA細胞に存在することを明らかにした。suhB欠失変異体は,炭素異化酵素抑制(CCR)の条件下で,テトラリン分解(thn)遺伝子発現の脱抑制とそれらのLysR型活性化因子ThnRのより高い量を示した。thnR mRNAのsuhBと5′UTRの間の相互作用は,in vitroで示された。さらに,thnR mRNAの5′UTRへのgfp融合の蛍光測定とhfq欠失変異体の表現型とを組み合わせた共免疫沈降実験は,この相互作用におけるHfqの関与を示唆する。まとめると,これらのデータは,thn遺伝子誘導を妨げるThnR mRNA翻訳において,suhBに対するHfq仲介抑制的役割を支持する。Sphingopyxis属において高度に保存されたsRNAであるsuhBは,S.granuli株TFAにおけるthn遺伝子発現のCCRに直接関与する最初の同定された要素である。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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微生物の生化学 , 遺伝子発現 , 生物学的機能

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