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J-GLOBAL ID：201802277685036735   整理番号：18A0492199

NFκB経路分析:フィードバックサイクルを用いた遺伝子共発現ネットワークを解析するためのアプローチ【Powered by NICT】

NFκB pathway analysis: An approach to analyze gene co-expression networks employing feedback cycles

著者 (5件)： Dillenburg Fabiane Cristine (Instituto de Informatica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil) ,  Zanotto-Filho Alfeu (Departamento de Farmacologia - Centro de Ciencias Biologicas - CCB, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianopolis, Santa Catarina, Brazil) ,  Fonseca Moreira Jose Claudio (Departamento de Bioquimica - Instituto de Ciencias Basicas da Saude - ICBS, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil) ,  Ribeiro Leila (Instituto de Informatica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil) ,  Carro Luigi (Instituto de Informatica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 72  ページ： 62-76  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： NFκB経路の遺伝子は,癌の転移とアポトーシスの阻害から生物学的過程の多くの制御に関与している。Gliobastoma多形(GBM)患者は異常なNFκB活性化を持つことが報告されているが,分子機構は完全には理解されていない。ここでは,非腫瘍性脳組織と比較して,GBMの腫瘍検体におけるNFκB経路解析,マイクロアレイから得られた量子化データを用いて構築した遺伝子共発現ネットワークの遺伝子間サイクルの異なる種類に基づいて提示した。サイクルは全ての頂点は異なる(最初と最後を除く)を持つ閉じた歩行である。遺伝子間の関係発見のこの方法のおかげで,遺伝子相関のよりロバストな解釈が可能である,サイクルは生物学的ネットワークにおける非常に一般的なフィードバック機構と関連しているからである。GBM試料では,NFκB経路調節に関与する遺伝子の間の化学量論的関係が不均衡であると結論した。これはサイクルの同定により測定し,説明することができる。この結論はこのタイプの腫瘍の生物学について理解を深めるのに役立つ。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  化学量論 ,  患者 ,  *NFκB ,  *ネットワーク ,  ロバスト性 ,  DNAマイクロアレイ ,  アポトーシス ,  腫瘍 ,  量子化
準シソーラス用語： 不均衡 ,  マイクロアレイ ,  分子機構 ,  生物学的過程 ,  *共発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： NFκB ,  マイクロアレイデータ解析 ,  遺伝子共発現ネットワーク ,  サイクル ,  フィードバック機構 ,  Gliobastoma多形性

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： NFκB ,  フィードバック ,  サイクル ,  遺伝子 ,  共発現 ,  解析