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J-GLOBAL ID：201802277938231786   整理番号：18A0288171

共転写RNA二次構造予測のための代替RNA構造発現を研究するためのin silico法【Powered by NICT】

In silico methods for co-transcriptional RNA secondary structure prediction and for investigating alternative RNA structure expression

著者 (2件)： Meyer Irmtraud M. (Laboratory of Bioinformatics of RNA Structure and Transcriptome Regulation, Berlin Institute for Medical Systems Biology, Max Delbrueck Center for Molecular Medicine, Robert-Rossle-Str. 10, 13125 Berlin-Buch, Germany) ,  Meyer Irmtraud M. (Institute of Chemistry and Biochemistry, Free University, Thielallee 63, 14195 Berlin, Germany)
資料名： Methods  (Methods)
巻： 120  ページ： 3-16  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0241A  ISSN： 1046-2023  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA転写物は,生物における活性遺伝子の一次生成物,多くのウイルスを含んでいる。細胞運命は一次配列シグナルに依存するだけでなく,RNA構造によって決定されることができる。最近の実験的証拠は,多くの転写物はそれらの細胞寿命を通して単一機能性RNA構造よりも帰属でき,転写物は細胞内で合成されるとして共転写起こり,すなわち構造形成を示した。さらに,機能性RNA構造は非コード転写物に限定されないが,またコード転写物を特徴づけることができる。浮かび上がる状況は機能的役割の広範囲を発揮させるためにはRNA構造はRNA転写物(及び蛋白質文脈などの情報の他の層の上に)にコード化される情報の付加層を構成することである。さらに,実際の細胞状況に依存して転写物の挙動を変化させるために,種々のコード化されたRNA構造は転写物の寿命の種々の段階で表すことができる。蛋白質コード化遺伝子の選択的スプライシングの概念と同様に,単一転写物は細胞状況に依存して異なる蛋白質を得ることができ,任意の与えられた転写物の選択的RNA構造表現の概念を提案しすることが適切であった。本レビューでは,著者らのグループはin vivoでRNA構造発現の異なる側面を検出するために開発したいくつかの計算戦略を紹介した。二つの側面に特に注目されている(1)共転写折畳み中に出現するRNA二次構造特徴と(2)は転写物の寿命の異なる時間で発現し,潜在的に相互排他的であることを機能性RNA構造の特徴。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 選択的スプライシング ,  ウイルス ,  タンパク質 ,  *構造形成 ,  *RNA【核酸】 ,  折畳み ,  遺伝子 ,  *予測 ,  符号化
準シソーラス用語： 機能性RNA ,  細胞寿命 ,  *RNA構造 ,  細胞運命 ,  *RNA二次構造 ,  *共転写 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNA二次構造 ,  RNA構造予測 ,  共転写折畳み ,  RNA折畳み経路 ,  予測アルゴリズム

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (7件)： 共転写 ,  RNA二次構造 ,  予測 ,  代替 ,  RNA構造 ,  発現 ,  研究