拡張スペクトルβ-ラクタマーゼ大腸菌ST131の院内発生の疫学的特性化はコアゲノム多座位配列タイピングの臨床的価値を確認する【Powered by NICT】

Woksepp Hanna; Woksepp Hanna; Ryberg Anna; Berglind Linda; Schon Thomas; Schon Thomas; Schon Thomas; Schon Thomas; Soderman Jan

文献

J-GLOBAL ID：201802277972191005 整理番号：18A0145391

拡張スペクトルβ-ラクタマーゼ大腸菌ST131の院内発生の疫学的特性化はコアゲノム多座位配列タイピングの臨床的価値を確認する【Powered by NICT】

Epidemiological characterization of a nosocomial outbreak of extended spectrum β-lactamase Escherichia coli ST-131 confirms the clinical value of core genome multilocus sequence typing

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資料名：
巻： 125 号： 12 ページ： 1117-1124 発行年： 2017年
JST資料番号： D0486D ISSN： 0903-4641 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

臨床的に疑わしい院内感染における疫学的タイピングの増強された精度は重要である。著者らの目的は,全ゲノム配列決定(WGS)データの一塩基多型(SNP)解析とコアゲノム(CG)多遺伝子座配列タイピング(MLST)は院内発生,以前の分子タイピング法に比べて同定より確実かどうかを調べることであった。スウェーデン南東部におけるESBL大腸菌ST131の院内発生と三名の対照株からの十六分離株をWGSに供した。配列はSNP解析とcgMLST。cgMLST発生分離株と対照株(>1400差)の間の区別により調べた。全て臨床的に同定された発生分離株は密接なクラスタリング(≧2対立遺伝子差),二種単離菌(>50対立遺伝子差)を除いて示した。これらのデータは,>50の異なる遺伝子を持つ単離菌は院内感染発生に属していないことを確認した。発生内のSNPの数は≦7であったが,二矛盾した分離株は700SNP>を持っていた。ESBL大腸菌ST131分離株の二は臨床的に同定された発生に属さなかった。著者らの結果は,分解能,疫学的データから判断して発生に属する患者の過大評価を避けるのWGSの能力を説明し,以前に低い識別能と分子的方法を採用した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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分子遺伝学一般

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