文献

J-GLOBAL ID：201802278117025632   整理番号：18A0436405

プローブ遺伝子機能への統合システム遺伝学とオミクスツールキット【Powered by NICT】

An Integrated Systems Genetics and Omics Toolkit to Probe Gene Function

著者 (24件)： Li Hao (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Wang Xu (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Rukina Daria (Institute of Mathematics, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Huang Qingyao (Laboratory of Metabolic Signaling, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Lin Tao (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Sorrentino Vincenzo (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Zhang Hongbo (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Bou Sleiman Maroun (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Arends Danny (Albrecht Daniel Thaer-Institut fuer Agrar- und Gartenbauwissenschaften, Humboldt-Universitaet zu Berlin, D-10115 Berlin, Germany) ,  McDaid Aaron (Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne 1015, Switzerland) ,  McDaid Aaron (Institute of Social and Preventive Medicine, University Hospital of Lausanne, Lausanne 1010, Switzerland) ,  Luan Peiling (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Ziari Naveed (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Velazquez-Villegas Laura A. (Laboratory of Metabolic Signaling, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Gariani Karim (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Kutalik Zoltan (Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Kutalik Zoltan (Institute of Social and Preventive Medicine, University Hospital of Lausanne, Lausanne 1010, Switzerland) ,  Schoonjans Kristina (Laboratory of Metabolic Signaling, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Radcliffe Richard A. (Department of Pharmaceutical Sciences, University of Colorado, Aurora, CO 80045, USA) ,  Prins Pjotr (University Medical Center Utrecht, 3584CT Utrecht, the Netherlands) ,  Prins Pjotr (Department of Genetics, Genomics and Informatics, University of Tennessee, Memphis, TN 38163, USA) ,  Morgenthaler Stephan (Institute of Mathematics, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland) ,  Williams Robert W. (Department of Genetics, Genomics and Informatics, University of Tennessee, Memphis, TN 38163, USA) ,  Auwerx Johan (Laboratory for Integrative and Systems Physiology, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne 1015, Switzerland)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 6  号： 1  ページ： 90-102.e4  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複雑な形質と共通疾患に影響する遺伝的および環境的因子の同定高生物医学的優先事項である。を開発し,検証し,遺伝子機能のシステム解離を促進するためのオープンアクセスウェブサーバー(システム遺伝学.org),(発現)フェノームワイド関連,トランスクリプトーム/プロテオーム関連,と(逆-)仲介分析を含む,一連の多層システムアプローチを実装した。BXDマウスの遺伝学的参照集団からマルチオミックスデータセットにこれらの方法を適用し,遺伝子と臨床的および分子的表現型の間の関係,Rpl26間の以前に報告されていないリンク・体重,Cpt1aと脂質代謝を含むを同定し,検証した。媒介と逆媒介分析を通して,遺伝子間の調節関係,BCKDHA,BCKDHB蛋白質レベルの同時制御などを確立し,転写因子E2F6,ZFP277,ZKSCAN1の標的を同定した。多面的ツールキットは,ロバストで,個体群および種横断的に翻訳遺伝子-遺伝子および遺伝子-表現型リンクの同定を可能にし,普遍的にマルチオミックスデータセットを用いたいずれの集団に適用することができる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 体重 ,  プロテオーム ,  個体群 ,  脂質代謝 ,  システムアプローチ ,  表現型 ,  *遺伝学 ,  *遺伝子 ,  トランスクリプトーム ,  *遺伝 ,  ロバスト性 ,  *プローブ ,  転写因子
準シソーラス用語： *ツールキット ,  *遺伝子機能 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： システム遺伝学 ,  QTL(量的形質遺伝子座) ,  PheWAS ,  TWAS溶射 ,  ePheWAS ,  媒介分析 ,  BXD ,  遺伝的参照集団

分類 (4件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  動物の代謝と栄養一般  (EJ02031R) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： プローブ ,  遺伝子機能 ,  統合システム ,  遺伝学