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J-GLOBAL ID：201802278364826318   整理番号：18A1964806

MALDI-TOFMS技術はrmpA2毒性遺伝子を運ぶ高毒性肺炎桿菌を迅速に区別する。【JST・京大機械翻訳】

Rapid detection of rmpA2-carrying hypervirulent Klebsiella pneumoniae by MALDI-TOF MS

著者 (5件)： Sun Qiaoling (浙江大学医学院附属第二医院検験科, 杭州,310029) ,  Shu Lingbin (浙江大学医学院附属第二医院検験科, 杭州,310029) ,  Hu Jie (浙江大学医学院附属第二医院検験科, 杭州,310029) ,  Hu Yanyan (浙江大学医学院附属第二医院検験科, 杭州,310029) ,  Zhang Rong (浙江大学医学院附属第二医院検験科, 杭州,310029)
資料名： Zhonghua Jianyan Yixue Zazhi  (Zhonghua Jianyan Yixue Zazhi)
巻： 41  号： 8  ページ： 571-576  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2341A  ISSN： 1009-9158  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】マトリックス支援レーザ脱離/イオン化飛行時間型質量分析(MALDI-TOFMS)によって,rmpA2遺伝子の高毒性肺炎桿菌の迅速識別の能力を評価する。方法:浙江大学医学院付属第二病院と河南省人民病院の57株の肺炎桿菌に対して、PCR増幅rmpA2毒力遺伝子及び莢膜血清型遺伝子、多部位配列タイピング法(MLST)をタイピングし、引かき試験を行って、高粘液表現型測定を行った。MALDI-TOFMSを用いて,肺炎桿菌を同定し,2次元解析とアルゴリズム統計を行い,サポートベクトルマシン(SVM)と遺伝的アルゴリズム(GA)を用いた。ニューラルネットワークアルゴリズム(SNN)と高速分類アルゴリズム(QC)のデータを解析し,対応するモデルを構築し,分類の特性ピークを得た。結果:57株の肺炎桿菌の中に28株がrmpA2の毒力遺伝子を持ち、MLSTはST11型で、その中、線引試験陽性は5株であった。29株はrmpA2遺伝子を持たないが,ST11(n=23)はST15(n=3),ST1,ST76,ST473の各株を含むST11(n=23)であった。質量スペクトルは肺炎桿菌を2つの領域に分割し、ClinProToolsソフトは84.2%(48/57)の菌株を正確に識別できた。ClinProToolsソフトウェアの4つのアルゴリズムの結果は基本的に類似しており、SVMの特異性と感度が最も高く、それぞれ93.23%と100%であった。ClinProToolsによる質量スペクトルピークの統計により、rmpA2遺伝子陽性群と陰性群を区別する2つの特徴ピークはそれぞれ7168.9と7280.76であり、ピーク強度に一定の差があることが分かった。結論:MALDI-TOFMSはrmpA2毒性遺伝子を運ぶ高毒性肺炎桿菌の方法の感度と特異性は90%以上であり、2つの特徴ピークのピーク強度に一定の差があり、更に検証する必要がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ソフトウェア ,  *遺伝子 ,  表現型 ,  *毒性 ,  PCR法 ,  病原性 ,  質量分析 ,  病院 ,  アルゴリズム ,  *肺炎桿菌 ,  脱着 ,  サポートベクトルマシン ,  *MALDI-TOF MS
準シソーラス用語： ピーク強度 ,  特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C)

タイトルに関連する用語 (3件)： 毒性遺伝子 ,  毒性 ,  肺炎桿菌