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J-GLOBAL ID：201802278505023524   整理番号：18A1293223

天然池におけるリーダー末端CRISPRフラグメント分析により検出されたMicrocystis個体群の不完全選択的掃引【JST・京大機械翻訳】

Incomplete Selective Sweeps of Microcystis Population Detected by the Leader-End CRISPR Fragment Analysis in a Natural Pond

著者 (7件)： Kimura Shigeko (Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Kimura Shigeko (School of Environmental Science, The University of Shiga Prefecture) ,  Uehara Mika (Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Morimoto Daichi (Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Yamanaka Momoko (Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Sako Yoshihiko (Graduate School of Agriculture, Kyoto University) ,  Yoshida Takashi (Graduate School of Agriculture, Kyoto University)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 425  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 淡水藍藻Microcystis aeruginosaはしばしば毒性のある大量のブルームを形成し,水生自然環境においてその感染性ファージを持つ腕レースに存在し,結果として,クラスター化した規則的間隔の短いパリンデミック反復(Cas)システムを含む非常に多様で精巧な抗ウイルス防御システムを進化させた。ここでは,ファージとプラスミドのような外因性移動遺伝要素に関連するMicrocystis個体群動態を評価するために,藍藻類ブルームが発生した2013年6月と10月の間の自然池で検出されたスペーサ配列を分析することにより,CRISPR遺伝子型(CTs)の時間的変動を調べた。全部で463,954の高品質リーダー末端CRISPR配列を得て,スペーサを含む配列を以前に報告した31のCTsに分類し,68の新しいCTsをリーダー末端スペーサの共有秩序に基づいて分類した。CT19は16の最も一般的なCTsの中で最も優勢な遺伝子型(32%)であり,CT52(14%)とCT58(9%)が続いた。CT19のスペーサレパートリーは,主に2つの異なるタイプを示した。CT19_起源は,以前に分離された株のCT19スペーサレパートリーと同じであり,CT19_新しい+は,CT19_起源のCRISPR領域のリーダー末端に新しいスペーサを含み,CT19配列の99.94%を占めた。驚くべきことに,著者らは,CT19_起源のプロ遺伝子型配列の大部分のリーダー末端において,CT19_起源の2番目から10番目のスペーサのスペーサレパートリーを観察した。これらは,2010年と2011年の同じ生態系における本研究と著者らの以前の研究のサンプリング中に観察され,これらのCTsはファージ圧力にもかかわらず2011年から2013年まで持続したことを示唆している。リーダー末端変異体は他のCT遺伝子型で観察された。これらの知見は,Microcystis個体群の不完全な選択的掃引を示した。以下の現象を説明した。Microcystisの豊度は季節的および劇的に変化し,Microcystis個体群は1年に1回ボトルネックを経験し,それにより,より古いCTsはより新しいスペーサの獲得後に発生するCTsとしての罹患率の増加の等しい機会を持つ。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 淡水 ,  毒性 ,  スペーサ ,  遺伝子型 ,  生態系 ,  経時変化 ,  *個体群 ,  ブルーム ,  遺伝子 ,  バクテリオファージ ,  クラスタ化 ,  プラスミド ,  ポピュレーションダイナミックス ,  Microcystis aeruginosa ,  *ミクロキスティス属 ,  *微生物 ,  改変 ,  *植物 ,  *隠花植物
準シソーラス用語： *Microcystis , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Microcystis aeruginosa ,  CRISPR ,  スペーサーの多様性 ,  不完全選択掃引 ,  ボトルネック ,  Founder効果

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： リーダー ,  CRISPR ,  フラグメント ,  分析 ,  Microcystis ,  個体群 ,  掃引