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J-GLOBAL ID:201802278517039656   整理番号:18A0275263

共役系の他の相同成分と種々のグラム陰性細菌におけるプロテアソームとに沿った,ユビキチン様蛋白質,UBactの同定【Powered by NICT】

Identification of UBact, a ubiquitin-like protein, along with other homologous components of a conjugation system and the proteasome in different gram-negative bacteria
著者 (4件):
資料名:
巻: 483  号:ページ: 946-950  発行年: 2017年 
JST資料番号: B0118A  ISSN: 0006-291X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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真核生物ユビキチン-プロテアソーム系に類似した系は,以前に古細菌,および放線細菌(グラム陽性)が,グラム陰性細菌ではなく同定されている。ここでは,新規原核生物ユビキチン様蛋白質の生物情報学的同定,UBact名を報告した。UBactの系統発生分布は少なくとも五グラム陰性細菌門,Nitrospirae,Armatimonadetes,Verrucomicroba,Nitrospinae,およびPlanctomycetesを含めて示した。加えて,七の候補(非培養)門と1つの古細菌で同定された。が見出される門における数種は配列決定されているためUBactは見落とされてきた可能性がある。UBactを同定したほとんどの種では,PupとPupをタグとして付けた基質の結合および/または分解に関与する遺伝子に相同な蛋白質のゲノムコード中のその隣接。PafA-,Dop-,Mpaとプロテアソーム相同蛋白質である。遺伝子関連はUBactの大きさと保存されたC末端G[E/Q]モチーフと同様に,強くUBactは分解のための共役可能なタグとして使用されていることを示唆した。C末端に関して,UBactは,特徴的なC末端ジグリシンモチーフを欠くユビキチンと最もユビキチン様蛋白質(マイコバクテリアPupを含む)とは異なっており,それは通常配列R[T/S]G[E/Q]で終わる。UBactを含む門は三十億年前に分岐していると考えられ,このユビキチン様共役系は進化の初期に進化したまたは遠位グラム陰性門におけるその発生は水平遺伝子移動の複数のインスタンスに起因することを示している。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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遺伝子の構造と化学  ,  細胞構成体の機能 
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