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J-GLOBAL ID：201802278832994858   整理番号：18A0331916

ジャガイモ(Solanum tuberosum)におけるWRKY遺伝子ファミリーのゲノムワイド同定と特性化【Powered by NICT】

Genome-wide identification and characterization of the WRKY gene family in potato (Solanum tuberosum)

著者 (10件)： Liu Qiu-Ning (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Liu Yu (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Xin Zhao-Zhe (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Zhang Dai-Zhen (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Ge Bao-Ming (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Yang Rui-Ping (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Wang Zheng-Fei (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Yang Li (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Tang Bo-Ping (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...) ,  Zhou Chun-Lin (Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, ...)
資料名： Biochemical Systematics and Ecology  (Biochemical Systematics and Ecology)
巻： 71  ページ： 212-218  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0821A  ISSN： 0305-1978  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： WRKY蛋白質は植物転写因子の大きなファミリーである生物的および非生物的ストレスに対する植物の発育,代謝,および応答のような多くの生物学的過程において重要な役割を果たしている。本研究はジャガイモゲノムを用いてWRKYファミリーの完全な概要を開発することを目的とした。全ゲノム解析に基づいて,全82StWRKYの蛋白質は配列相同性,モチーフ多様性,そして系統的関係に従って三群(I,II,およびIII)と五のサブグループ(IIa,IIb,IIc,IId,IIe)に特性化し,分類した。多重配列アラインメントを用いて,WRKYGQR,新規モチーフはStWRKY076と共に新しい生物学的機能を行う可能性があることがWRKYGQKヘプタペプチド(WRKYGMK,WHKCGQK,WRKYGKK)の三種類から同定した。染色体位置分析は82StWRKY蛋白質は12個の染色体の11に位置し,第11染色体を除くことを示した。系統発生分析も82StWRKYタンパクは大きく三種の大きな群およびWRKYの典型的な特性を共有する五サブグループにクラスタ化できることを示した。結果はジャガイモにおけるWRKY遺伝子の機能のさらなる解析と理解を知らせるための基本的な情報を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 生物活性 ,  染色体 ,  タンパク質 ,  転写因子 ,  *キャラクタリゼーション ,  配列相同性 ,  *遺伝子 ,  系統発生 ,  クラスタ化 ,  *ジャガイモ
準シソーラス用語： 系統解析 ,  全ゲノム解析 ,  非生物的ストレス ,  *遺伝子ファミリー ,  *WRKY蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Solanum tuberosum(ジャガイモ) ,  WRKY ,  転写因子 ,  ゲノムワイド解析 ,  系統発生解析

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (7件)： ジャガイモ ,  Solanum ,  WRKY ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  特性化