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J-GLOBAL ID：201802279017278781   整理番号：18A2149758

開口ナトリウムチャンネルの開放ゲート維持における相互作用モチーフの役割【JST・京大機械翻訳】

Role of the Interaction Motif in Maintaining the Open Gate of an Open Sodium Channel

著者 (4件)： Ke Song (Institute of Natural Sciences and School of Physics and Astronomy, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Ulmschneider Martin B. (Department of Chemistry, King’s College London, London, United Kingdom) ,  Wallace B.A. (Institute of Structural and Molecular Biology, Birkbeck College, University of London, London, United Kingdom) ,  Ulmschneider Jakob P. (Institute of Natural Sciences and School of Physics and Astronomy, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 115  号： 10  ページ： 1920-1930  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 電位依存性ナトリウムチャンネルは,開放,閉鎖および不活性化状態の間の遷移を受け,膜を横切るナトリウムイオンの移動の調節を可能にする。活性化開放立体配座における完全長原核生物NavMs結晶構造の最近発表された結晶構造は,電圧センサ,S4-S5リンカー,細孔及びC末端ドメインにおける残基を含む広範囲の塩橋ネットワークから成る新規モチーフの存在を明らかにした。このモチーフは,チャンネルを通してイオン移動を可能にするオープン立体配座の維持に関与することが提案されている。本研究では,完全長NavMsの相互作用ネットワークがゲートの急速な崩壊と閉鎖を妨げることを実証するために,人工的な拘束なしで長時間分子動力学計算を用いた。この場合,ゲートが開かれなければならない孔のみの構築物の以前の研究と著しく異なる。興味あることに,ナノスコピックなレベルでの頻繁に議論された「疎水性ゲーティング」機構もシミュレーションで観察され,その中では,ゲート領域に近い不連続な水ワイヤがイオン伝導のためのエネルギー障壁をもたらす。加えて,オープンチャンネルの安定性と機能に対するモチーフにおけるいくつかの重要残基のin silico変異の影響を示し,これらをヒトナトリウムチャンネルにおけるこのチャンネルと相同疾患関連変異に関する既存の機能的研究と関連付けた。また,開いたゲートを維持する際の電圧センサとC末端ドメインの切断/除去の効果も調べた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 疎水性 ,  *ナトリウムチャンネル ,  ヒト ,  ネットワーク ,  *開口 ,  高速度 ,  細孔 ,  立体配座 ,  計算機シミュレーション ,  結晶構造 ,  *相互作用 ,  変異 ,  *チャネル
準シソーラス用語： ゲーティング ,  分子動力学シミュレーション ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 細胞膜の輸送  (EF04020R)

タイトルに関連する用語 (5件)： ナトリウムチャンネル ,  ゲート ,  相互作用 ,  モチーフ ,  役割