文献

J-GLOBAL ID：201802279078087739   整理番号：18A1804027

通常の海洋生態学的状態評価ネットワークへのメタバーコーディングに基づく底生生物モニタリングの適応【JST・京大機械翻訳】

Adapting metabarcoding-based benthic biomonitoring into routine marine ecological status assessment networks

著者 (5件)： Aylagas Eva (AZTI - Marine Research Division, Herrera Kaia, Portualdea z/g, 20110 Pasaia, Gipuzkoa, Spain) ,  Aylagas Eva (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST), Red Sea Research Center (RSRC), Biological and Environmental Sciences and Engineering (BESE), Thuwal 23955-6900, Saudi Arabia) ,  Borja Angel (AZTI - Marine Research Division, Herrera Kaia, Portualdea z/g, 20110 Pasaia, Gipuzkoa, Spain) ,  Muxika Inigo (AZTI - Marine Research Division, Herrera Kaia, Portualdea z/g, 20110 Pasaia, Gipuzkoa, Spain) ,  Rodriguez-Ezpeleta Naiara (AZTI - Marine Research Division, Herrera Kaia, Portualdea z/g, 20110 Pasaia, Gipuzkoa, Spain)
資料名： Ecological Indicators  (Ecological Indicators)
巻： 95  号： P1  ページ： 194-202  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1221A  ISSN： 1470-160X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生物多様性評価を支援するためのゲノムアプローチの利用は,非常に時間がかかり費用がかかる従来のバイオモニタリングの代替法である。迅速なコミュニティ記述のための高い要求に応じて,DNAメタコーディングは,迅速に,そして,低コストで,分類学を同時に数百のサンプルに割り当てることができる。しかし,この技術はバイオモニタリングネットワークプログラムにまだ組み込まれていない。ここでは,この地域におけるヨーロッパの水枠組み指令の適用のための適格な権威であるBasque Water Agentの監視ネットワーク内のステーションにおいて,DNAのメタコード化手法を適用した。著者らは,形態学と代謝に基づく分類学的同定を用いて,18の河口と沿岸堆積物試料から底生大型無脊椎動物群集を特性化し,AZTIの海洋生物指標(AMBI)のいくつかのバージョンの性能を評価した。形態学を通して同定された206の分類群に対して,メタカルコーディングは112の分類群を検出したが,著者らは,代謝コード化が従来の技術と比較して類似のバイオモニタリングの結論をもたらすことを示した。形態学的方法論から検出されたこれらの分類群の豊度とバイオマスを用いて,著者らは,代謝コード化アプローチで得られた読み取り数と有意な正の相関を見出した。個体のバイオマス,(B)AMBIから導出された読出し数,Gambiおよび形態学に基づく指標から得られた代謝産物に基づく指標は,最良の相関を示し,分析された観測所の生態学的状態の決定において優れた一致を示した。著者らは,Basqueモニタリングネットワークに含まれる51のステーションの分析のために,メタコード化が55%より少なく,72%より少ない時間消費であることを計算した。著者らの研究の結果は,生態学的評価の分野における政策立案者と研究者に関連しており,集中的なモニタリングプログラムへのDNA代謝の迅速な実施に貢献するであろう。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 河口 ,  *底生生物 ,  ヨーロッパ ,  DNA【核酸】 ,  バイオマス ,  代謝 ,  生物多様性 ,  コミュニティ ,  キャラクタリゼーション ,  生物指標 ,  *ネットワーク ,  モルフォロジー ,  ゲノム
準シソーラス用語： 分類群 ,  バイオモニタリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 生物指標 ,  ネットワークプログラムのモニタリング ,  メタバーコーディング ,  海洋状態評価 ,  環境管理 ,  EDNA

分類 (3件)： 海洋汚濁  (SB02040B) ,  研究開発  (SA01040R) ,  生態系  (EE01040P)

タイトルに関連する用語 (7件)： 海洋 ,  生態学的状態 ,  評価 ,  メタバーコーディング ,  底生生物 ,  モニタリング ,  適応