文献

J-GLOBAL ID：201802279390376406   整理番号：18A1114833

循環代謝産物,免疫遺伝子ネットワークおよびそれらの遺伝的調節の相互作用マップ【JST・京大機械翻訳】

An interaction map of circulating metabolites, immune gene networks, and their genetic regulation

著者 (53件)： Nath Artika P. (Department of Microbiology and Immunology, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Nath Artika P. (Systems Genomics Lab, Baker Heart and Diabetes Institute, Melbourne, Australia) ,  Ritchie Scott C. (Systems Genomics Lab, Baker Heart and Diabetes Institute, Melbourne, Australia) ,  Ritchie Scott C. (Department of Pathology, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Byars Sean G. (Department of Pathology, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Byars Sean G. (School of BioSciences, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Fearnley Liam G. (Department of Pathology, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Fearnley Liam G. (School of BioSciences, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Havulinna Aki S. (National Institute for Health and Welfare, Helsinki, Finland) ,  Havulinna Aki S. (Institute for Molecular Medicine Finland, University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Joensuu Anni (National Institute for Health and Welfare, Helsinki, Finland) ,  Kangas Antti J. (Computational Medicine, Faculty of Medicine, University of Oulu, Oulu, Finland) ,  Soininen Pasi (Computational Medicine, Faculty of Medicine, University of Oulu, Oulu, Finland) ,  Soininen Pasi (NMR Metabolomics Laboratory, School of Pharmacy, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland) ,  Wennerstrom Annika (National Institute for Health and Welfare, Helsinki, Finland) ,  Milani Lili (University of Tartu, Estonian Genome Center, Tartu, Estonia) ,  Metspalu Andres (University of Tartu, Estonian Genome Center, Tartu, Estonia) ,  Maennisto Satu (National Institute for Health and Welfare, Helsinki, Finland) ,  Wuertz Peter (Computational Medicine, Faculty of Medicine, University of Oulu, Oulu, Finland) ,  Wuertz Peter (Diabetes and Obesity Research Program, University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Kettunen Johannes (National Institute for Health and Welfare, Helsinki, Finland) ,  Kettunen Johannes (Computational Medicine, Faculty of Medicine, University of Oulu, Oulu, Finland) ,  Kettunen Johannes (NMR Metabolomics Laboratory, School of Pharmacy, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland) ,  Kettunen Johannes (Biocenter Oulu, University of Oulu, Oulu, Finland) ,  Raitoharju Emma (Department of Clinical Chemistry, Fimlab Laboratories and Finnish Cardiovascular Research Center-Tampere, Faculty of Medicine and Life Sciences, University of Tampere, Tampere, Finland) ,  Kaehonen Mika (Department of Clinical Physiology, University of Tampere and Tampere University Hospital, Tampere, Finland) ,  Juonala Markus (Department of Medicine, University of Turku and Division of Medicine, Turku University Hospital, Turku, Finland) ,  Juonala Markus (Murdoch Childrens Research Institute, Parkville, Australia) ,  Palotie Aarno (Institute for Molecular Medicine Finland, University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Palotie Aarno (Analytic and Translational Genetics Unit, Department of Medicine, Massachusetts General Hospital, Boston, USA) ,  Palotie Aarno (Program in Medical and Population Genetics, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, USA) ,  Palotie Aarno (Psychiatric & Neurodevelopmental Genetics Unit, Department of Psychiatry, Massachusetts General Hospital, Boston, USA) ,  Ala-Korpela Mika (Computational Medicine, Faculty of Medicine, University of Oulu, Oulu, Finland) ,  Ala-Korpela Mika (NMR Metabolomics Laboratory, School of Pharmacy, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland) ,  Ala-Korpela Mika (Biocenter Oulu, University of Oulu, Oulu, Finland) ,  Ala-Korpela Mika (Computational Medicine, School of Social and Community Medicine, University of Bristol, Bristol, UK) ,  Ala-Korpela Mika (Medical Research Council Integrative Epidemiology Unit, University of Bristol, Bristol, UK) ,  Ripatti Samuli (Institute for Molecular Medicine Finland, University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Ripatti Samuli (Department of Public Health, University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Lehtimaeki Terho (Department of Clinical Chemistry, Fimlab Laboratories and Finnish Cardiovascular Research Center-Tampere, Faculty of Medicine and Life Sciences, University of Tampere, Tampere, Finland) ,  Abraham Gad (Systems Genomics Lab, Baker Heart and Diabetes Institute, Melbourne, Australia) ,  Abraham Gad (Department of Pathology, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Abraham Gad (School of BioSciences, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Raitakari Olli (Department of Clinical Physiology and Nuclear Medicine, Turku University Hospital, Turku, Finland) ,  Raitakari Olli (Research Centre of Applied and Preventive Cardiovascular Medicine, University of Turku, Turku, Finland) ,  Salomaa Veikko (National Institute for Health and Welfare, Helsinki, Finland) ,  Perola Markus (National Institute for Health and Welfare, Helsinki, Finland) ,  Perola Markus (Institute for Molecular Medicine Finland, University of Helsinki, Helsinki, Finland) ,  Perola Markus (University of Tartu, Estonian Genome Center, Tartu, Estonia) ,  Inouye Michael (Department of Microbiology and Immunology, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Inouye Michael (Systems Genomics Lab, Baker Heart and Diabetes Institute, Melbourne, Australia) ,  Inouye Michael (Department of Pathology, The University of Melbourne, Parkville, Australia) ,  Inouye Michael (School of BioSciences, The University of Melbourne, Parkville, Australia)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 146  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:免疫代謝は多くの心臓代謝疾患において中心的役割を果たす。しかしながら,循環するヒト細胞における免疫関連遺伝子ネットワークのロバストなマップ,代謝産物との相互作用,およびそれらの遺伝的制御はまだ欠けている。ここでは,7年間の追跡調査において,マッチした複数のデータを持つ個体のサブセットを含む,2つの集団に基づくコホート(全N=2168)から血液トランスクリプトーム,メタボロミクスおよびゲノムプロファイルを統合した。【結果】細胞毒性,ウイルス反応,B細胞,血小板,好中球,および肥満細胞/好塩基球活性を含む多様な免疫機能に富むトポロジー的に複製可能な遺伝子ネットワークを同定する。これらの免疫遺伝子モジュールは,リポ蛋白質サブクラス,脂質,脂肪酸,アミノ酸,小分子,およびCRPを含む158の循環代謝産物との関連の複雑なパターンを示す。モジュール発現量的形質遺伝子座(mQTL)に対するゲノムワイド走査は,シスおよびトランス効果の両方を有するmQTLを有する5つのモジュールを明らかにする。最も強いmQTLはARHGEF3(rs1354034)にあり,血小板数に依存しない血小板機能に富むモジュールに影響する。肥満細胞/好塩基球および好中球機能のモジュールは,7年間の追跡調査にわたって時間的に安定な代謝産物関連性を示し,これらのモジュールおよびそれらの構成遺伝子産物が代謝炎症において中心的役割を果たす可能性があるという証拠を提供する。さらに,ARHGEF3における最強mQTLは明らかな時間的安定性を示し,この遺伝子座における広範なトランス効果を支持した。結論:本研究は,血液免疫代謝界面における自然変動の詳細なマップとその遺伝的基礎を提供し,心臓代謝疾患における個人間変動を説明するためのその後の研究を促進する可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 好塩基球 ,  ウイルス ,  ヒト ,  *代謝産物 ,  好中球 ,  *遺伝 ,  *代謝 ,  *相互作用 ,  *遺伝子 ,  炎症 ,  アミノ酸 ,  トランスクリプトーム ,  脂質 ,  脂肪酸
準シソーラス用語： メタボロミクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (95件)：

• Science; Adipose expression of tumor necrosis factor-alpha: direct role in obesity-linked insulin resistance; GS Hotamisligil, NS Shargill, BM Spiegelman; 259; 5091; 1993; 87-91; 10.1126/science.7678183; CR1;
• J Clin Investig; Obesity is associated with macrophage accumulation; SP Weisberg, D Mccann, M Desai, M Rosenbaum, RL Leibel, AW Ferrante; 112; 12; 2003; 1796-808; 10.1172/JCI200319246; CR2;
• J Clin Invest; Glucose-induced beta cell production of IL-1 beta contributes to glucotoxicity in human pancreatic islets; K Maedler, P Sergeev, F Ris, J Oberholzer, HI Joller-jemelka, GA Spinas; 110; 6; 2002; 851-60; 10.1172/JCI200215318; CR3;
• Endocrinology; Free fatty acids induce a proinflammatory response in islets via the abundantly expressed interleukin-1 receptor I; M Böni-Schnetzler, S Boller, S Debray, K Bouzakri, DT Meier, R Prazak; 150; 12; 2009; 5218-29; 10.1210/en.2009-0543; CR4;
• J Clin Endocrinol Metab; Increased interleukin (IL)-1beta messenger ribonucleic acid expression in beta-cells of individuals with type 2 diabetes and regulation of IL-1beta in human islets by glucose and autostimulation; M Böni-Schnetzler, J Thorne, G Parnaud, L Marselli, JA Ehses, J Kerr-Conte; 93; 10; 2008; 4065-74; 10.1210/jc.2008-0396; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： 循環 ,  代謝産物 ,  免疫 ,  遺伝子ネットワーク ,  遺伝的調節 ,  相互作用 ,  マップ