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J-GLOBAL ID：201802279556010861   整理番号：18A0573638

AutoMorph:自動化された2次元および3次元画像処理と形状抽出と加速形態計測【Powered by NICT】

AutoMorph: Accelerating morphometrics with automated 2D and 3D image processing and shape extraction

著者 (12件)： Hsiang Allison Y. (Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, CT, USA) ,  Hsiang Allison Y. (Department of Bioinformatics and Genetics, Swedish Museum of Natural History, Stockholm, Sweden) ,  Nelson Kaylea (Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, CT, USA) ,  Elder Leanne E. (Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, CT, USA) ,  Sibert Elizabeth C. (Harvard Society of Fellows, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Sibert Elizabeth C. (Department of Earth and Planetary Sciences, Harvard University, Cambridge, MA, USA) ,  Kahanamoku Sara S. (Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, CT, USA) ,  Kahanamoku Sara S. (Department of Integrative Biology and Museum of Paleontology, University of California, Berkeley, CA, USA) ,  Burke Janet E. (Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, CT, USA) ,  Kelly Abigail (Smithsonian Tropical Research Institute, Balboa, Panama) ,  Liu Yusu (Department of Materials Science and Engineering, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA) ,  Hull Pincelli M. (Department of Geology and Geophysics, Yale University, New Haven, CT, USA)
資料名： Methods in Ecology and Evolution  (Methods in Ecology and Evolution)
巻： 9  号： 3  ページ： 605-612  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2682A  ISSN： 2041-210X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 形態学的変化の大規模な比較研究は,形状定量時間性質のためには稀である。データギャップは解決すべき重要な,種内および種間の形態学的変化は,支持と反映する生態学的および進化的過程。ここでは,ハイスループット物体と形状抽出のための新しいソフトウェアパッケージ,AutoMorphを詳述した。AutoMorphは多くのタイプの生物(例えば,有孔虫,軟体動物及び魚類歯)を画像化バッチ,群集スケール形態学的データの迅速な産生を可能にする。AutoMorphを用いて約1年後に>100,000海産微化石の2Dおよび3D形態学的データを画像化し,生成した。著者らの共同研究者はAutoMorphプロセス>12,000にpatellogastropodシェルと>50,000魚の歯を使用した。AutoMorphは,ユーザが大量の形態学的データを迅速に得ることを可能にする,コミュニティ規模の進化的および生態学的研究を促進した。自動アプローチの採用を促進するために,著者らはAutoMorph自由に利用可能でありオープンソースとなった。AutoMorphは全てUNIXライクシステム上で走る将来バージョンは,すべてのプラットフォームに跨って実施する予定である。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *形状測定 ,  有孔虫 ,  プログラムパッケージ ,  モルフォロジー ,  生態学 ,  微化石 ,  *自動化 ,  三次元 ,  *形態 ,  *二次元 ,  コミュニティ
準シソーラス用語： オープンソース ,  画像化 ,  ハイスループット ,  *三次元画像処理 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： 自動データ抽出 ,  二枚貝 ,  有孔虫 ,  幾何学的形態計測 ,  ichthyoliths(微小魚類骨片) ,  大型化石 ,  微化石 ,  patellogastropoda ,  写真測量 ,  仮想古生物学

分類 (5件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  動植物被害  (SB02090E) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  水圏・生物圏の地球化学  (DD01030A) ,  中生代  (DE03030R)

タイトルに関連する用語 (5件)： 自動化 ,  2次元 ,  3次元画像処理 ,  加速 ,  形態計測