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J-GLOBAL ID：201802279725796532   整理番号：18A0473523

蛋白質の指向性進化における拍動バイアス:コンビナトリアルライブラリー構築のための高忠実度結合オンチップ固相遺伝子合成効率的な遺伝子集合【Powered by NICT】

Beating Bias in the Directed Evolution of Proteins: Combining High-Fidelity on-Chip Solid-Phase Gene Synthesis with Efficient Gene Assembly for Combinatorial Library Construction

著者 (9件)： Li Aitao (Department of Synthetic Organic Chemistry, Max-Planck-Institut fuer Kohlenforschung, Kaiser-Wilhelm-Platz 1, 45470, Muelheim, Germany) ,  Li Aitao (Department of Chemistry, Philipps-Universitaet Marburg, 35032, Marburg, Germany) ,  Li Aitao (Hubei Collaborative Innovation Center for, Green Transformation of Bio-Resources, Hubei Key Laboratory of Industrial Biotechnology, College of Life Sciences, Hubei University, 368 Youyi Road, Wuchang Wuhan, 430062, P.R. China) ,  Acevedo-Rocha Carlos G. (Biosyntia ApS, 2100, Copenhagen, Denmark) ,  Sun Zhoutong (Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, 32 West 7th Avenue, Tianjin Airport Economic Area, Tianjin, 300308, P.R. China) ,  Cox Tony (Twist Bioscience, 455 Mission Bay Boulevard South, San Francisco, CA, 94158, USA) ,  Xu Jia Lucy (Twist Bioscience, 455 Mission Bay Boulevard South, San Francisco, CA, 94158, USA) ,  Reetz Manfred T. (Department of Synthetic Organic Chemistry, Max-Planck-Institut fuer Kohlenforschung, Kaiser-Wilhelm-Platz 1, 45470, Muelheim, Germany) ,  Reetz Manfred T. (Department of Chemistry, Philipps-Universitaet Marburg, 35032, Marburg, Germany)
資料名： ChemBioChem  (ChemBioChem)
巻： 19  号： 3  ページ： 221-228  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1258A  ISSN： 1439-4227  CODEN： CBCHFX  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 飽和変異誘発(SM)は有機化学及び代謝経路とゲノムの操作における触媒としての選択的酵素の指向性進化の広く使用されている技術を構成するが,ライブラリーの品質は,固有のアミノ酸バイアスのために最適である。ここでは,この基本的な問題は,シリコンチップとそれに続く効率的な遺伝子組立に高忠実度固相化学的遺伝子合成を適用して解くことができるかを示した。リモネンエポキシドヒドロラーゼは,(R,R)-および(S,S) シクロヘキサン 1,2 ジオールの立体選択的生成によるシクロヘキセンオキシドのモデル非対称化における触媒として選択した。伝統的な組合せPCR SMライブラリー,減少したアミノ酸アルファベットを用いていくつかの残基の同時ランダム化により生成した,それぞれの合成ライブラリーを構築し,比較した。大量配列決定を用いたDNAレベルでの統計的分析は,合成アプローチでは,理論的に可能なDNA変異体の97%が形成されることを示したが,伝統的なSMライブラリーはわずか約50%を含んでいた。蛋白質レベルでのスクリーニングも合成ライブラリーの優位性を示した。発見されている多くの高度に(R,R)-および(S,S)-選択的変異体は,従来のSMライブラリーには見いだされなかった。合成遺伝子減少の価格を用いて,このアプローチは,将来の指向性進化への道を示している可能性がある。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ジオール ,  *固相 ,  アミノ酸 ,  ゲノム ,  *遺伝子 ,  触媒 ,  非対称性 ,  代謝経路 ,  *タンパク質 ,  統計解析 ,  有機化学 ,  酵素 ,  DNA【核酸】 ,  *バイアス
準シソーラス用語： *定向進化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 指向性進化 ,  酵素 ,  ポリメラーゼ連鎖反応 ,  飽和変異誘発 ,  固相合成

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  酵素の応用関連  (EB09100B)

タイトルに関連する用語 (10件)： 蛋白質 ,  指向性進化 ,  拍動 ,  コンビナトリアルライブラリー ,  構築 ,  高忠実度 ,  オンチップ ,  固相 ,  遺伝子 ,  集合