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J-GLOBAL ID：201802279907679047   整理番号：18A1907944

超平面遺伝的クラスタ化による遺伝子転写調節のモデリング【JST・京大機械翻訳】

Modeling Gene Transcriptional Regulation by Means of Hyperplanes Genetic Clustering

著者 (4件)： Frasca Fabrizio (Politecnico di Milano, Piazza L. Da Vinci, Milan, 32, 20133, Italy) ,  Matteucci Matteo (Politecnico di Milano, Piazza L. Da Vinci, Milan, 32, 20133, Italy) ,  Masseroli Marco (Politecnico di Milano, Piazza L. Da Vinci, Milan, 32, 20133, Italy) ,  Morelli Marco (Center for Genomic Science of IIT@SEMM, Istituto Italiano di Tecnologia (IIT), Milan, 20139, Italy)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2018  号： IJCNN  ページ： 1-8  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現を調節する生物学的過程の広い文脈において,後成的活性により駆動される転写調節は最も効果的で興味深いものである。ヒストン修飾と転写因子結合の複雑な言語を理解することは,多くの関与する特徴と遺伝子を通してのそれらの組合せ挙動の特異性を与えられているが,依然として困難な仕事である。後成的活性からmRNA豊度定量化を予測するための全ゲノム回帰モデルは探索的枠組みにおいて興味深いが,それらの有効性はそのようなレベルの分解能で識別するのが困難であるため,それらの有効性は制限されている。一方,調査分析は,遺伝子の敏感なグループ化を行い,後成的規則化プロセスを局所的に研究するために,事前の生物学的知識に頼ることができない。この文脈において,著者らは,後成的特徴に基づく超平面クラスタリングの形式として「遺伝子層別化問題」を形成し,それらの発現と関連した後成的活性の間の特徴的な関係に基づいて,生物の蛋白質コード化遺伝子の全セットのデータ駆動分割を行うことを目的とした遺伝的アルゴリズムを提案した。得られた分割により記述される超平面だけでなく,異なる後成的特徴が各分割内の遺伝子発現の予測において多様な重要性をもつかどうかを観察した。これは,提案した計算法と得られた結果の妥当性と生物学的興味を実証した。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  転写因子 ,  *遺伝 ,  *モデリング ,  ゲノム ,  遺伝子発現 ,  回帰モデル ,  *遺伝子 ,  mRNA ,  層別 ,  *クラスタ化
準シソーラス用語： 特異性 ,  ヒストン修飾 ,  *転写調節 ,  *超平面 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (5件)： 超平面 ,  クラスタ化 ,  遺伝子転写 ,  調節 ,  モデリング