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J-GLOBAL ID：201802280042554986   整理番号：18A0145002

基質および生成物特異性の計算機キャラクタリゼーションおよびArabidopsis,イネとトウモロコシからのヒストンリジンメチルトランスフェラーゼにおけるS-アデノシルメチオニン結合ポケットの機能性【Powered by NICT】

Computational characterization of substrate and product specificities, and functionality of S-adenosylmethionine binding pocket in histone lysine methyltransferases from Arabidopsis, rice and maize

著者 (7件)： Satish Mutyala (Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Hyderabad, Kandi, Sangareddy, Telangana, 502285, India) ,  Nivya M. Angel (Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Hyderabad, Kandi, Sangareddy, Telangana, 502285, India) ,  Abhishek Suman (Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Hyderabad, Kandi, Sangareddy, Telangana, 502285, India) ,  Nakarakanti Naveen Kumar (Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Hyderabad, Kandi, Sangareddy, Telangana, 502285, India) ,  Shivani Dixit (Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Hyderabad, Kandi, Sangareddy, Telangana, 502285, India) ,  Vani Madishetti Vinuthna (Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Hyderabad, Kandi, Sangareddy, Telangana, 502285, India) ,  Rajakumara Eerappa (Department of Biotechnology, Indian Institute of Technology Hyderabad, Kandi, Sangareddy, Telangana, 502285, India)
資料名： Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics  (Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics)
巻： 86  号： 1  ページ： 21-34  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0761A  ISSN： 0887-3585  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼ(HKMTs)によるヒストンリジンメチル化は遺伝子発現の調節に関与している。動物HKMT機能の役割と機構を理解するためになされてきたが,ごく少数の植物HKMTsは機能的に特性化した。ヒストン基質特異性,メチル化度と触媒活性を明らかにするために,Arabidopsis,配列と構造比較によるトウモロコシとイネのArabidopsis Trithorax-like蛋白質(ATX),Su(var)3 9ホモログ蛋白質(SUVH),Su(var)3 9関連蛋白質(SUVR),ATXR5,ATXR6,とE(Z)HKMTsを分析した。ATXsはヒストン3リジン4(H3K4)へのメチル基転移酵素特異性を示す可能性があり,トリメチル化を触媒する可能性があることを示した。著者らの分析は,Arabidopsisの最もSUVH蛋白質はヒストンH3リジン9(H3K9)に結合することを示した。SUVH7,SUVH8,SUVR1,SUVR3,ZmSET20とZmSET22はH3K9のモノメチル化またはジメチル化を触媒することを予測した。SDG728,H3K9をtrimethylate可能性を除いて,イネにおける全てのSUVHパラログがモノメチル化またはジメチル化を触媒する可能性がある。ZmSET11,ZmSET31,SDG713,SDG715,SDG726蛋白質は不完全なS-アデノシルメチオニン(SAM)結合ポケットとポストSETドメインのために,触媒的に不活性であると予測された。E(Z)相同体はH3K27基板,ヒトのZesteホモログ2のエンハンサーに類似してtrimethylateことができる。著者らの比較配列解析はATXR5およびATXR6は蛋白質-蛋白質相互作用およびポリコーム抑制複合体2複合体形成に必要なモチーフ/ドメインを欠くことを明らかにした。触媒ポケット周囲,基板またはSAM結合ポケットでの鍵となる残基または前述の植物種のHKMTsにおける前SETとポストSETドメインの存在の微妙な変化はクラス特異的HKMT機能の変化をもたらし,さらにそれらの基質特異性,メチル化度と触媒活性を決定することを提案した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *基質 ,  ヒト ,  遺伝子発現 ,  複合体 ,  基質特異性 ,  触媒 ,  *Arabidopsis ,  *メチルトランスフェラーゼ ,  メチル化 ,  *結合部位 ,  *ヒストン ,  触媒活性
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  ジメチル化 ,  *特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： ATX ,  ATXR ,  E(Z) ,  EZ H2 ,  ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼ ,  セット ,  SETドメイン群 ,  SUVH

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (11件)： 基質 ,  生成物 ,  特異性 ,  計算機 ,  キャラクタリゼーション ,  Arabidopsis ,  イネ ,  トウモロコシ ,  S-アデノシルメチオニン ,  結合ポケット ,  機能性