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J-GLOBAL ID：201802280412081536   整理番号：18A0331169

アワ(Setaria italica)におけるSiDof遺伝子ファミリーの全ゲノム特性化【Powered by NICT】

Genome-wide characterization of the SiDof gene family in foxtail millet (Setaria italica)

著者 (5件)： Zhang Li (Institute of Molecular Agriculture & Bioenergy, Shanxi Agricultural University, Taigu, 030801, China) ,  Liu Baoling (Institute of Molecular Agriculture & Bioenergy, Shanxi Agricultural University, Taigu, 030801, China) ,  Zheng Gewen (Seed Management Station, Agriculture Department of Shanxi Province, Taiyuan, 030006, China) ,  Zhang Aiying (Institute of Millet, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Changzhi, 046011, China) ,  Li Runzhi (Institute of Molecular Agriculture & Bioenergy, Shanxi Agricultural University, Taigu, 030801, China)
資料名： BioSystems  (BioSystems)
巻： 151  ページ： 27-33  発行年： 2017年 
JST資料番号： D0286B  ISSN： 0303-2647  CODEN： BSYMBO  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物にのみ見られる転写因子のクラスを構成するDof(1フィンガーとのDNA結合)蛋白質は,成長と発達に影響を与える多くの生理学的および生化学的反応に関与している。SiDof遺伝子のゲノムワイド分析は,本研究で行った。三十五SiDof遺伝子を同定し,それらの遺伝子は,Seteria italicaゲノム中で九個の染色体全体に不規則に分布した。蛋白質長さ,分子量,および理論的等電点SiDofsはすべての大きく変化する。遺伝子構造解析が最もSiDof遺伝子はイントロンを欠いていることを示した。Arabidopsis thaliana,イネ,ソルガムおよびSetaria viridisからSiDof蛋白質とDof蛋白質の系統発生解析は,六種類の主要なグループを明らかにした。RNA-Seqデータの解析から,SiDof遺伝子発現レベルは根,茎,葉,およびスパイクを横切って変化することを示した。添加では,ストレスに応答してSiDof遺伝子の発現プロファイリングはSiDof7とSiDof15は乾燥ストレスシグナル伝達に関与していることを示唆した。全体として,この研究はアワにおける更なる研究のためのSiDofsに関する新しい情報を提供することができた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： イントロン ,  *ゲノム ,  等電点 ,  化学反応 ,  タンパク質 ,  *キャラクタリゼーション ,  転写因子 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  遺伝子発現 ,  モロコシ属 ,  系統発生 ,  構造解析 ,  *エノコログサ属
準シソーラス用語： 乾燥ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Setaria italica ,  Dof転写因子 ,  系統発生解析 ,  発現プロファイリング

分類 (2件)： 畑作物一般  (FC03031E) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： アワ ,  Setaria ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  特性化