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J-GLOBAL ID：201802280461846127   整理番号：18A1139927

中国のヤギのこぶ胃におけるMethanomassiicoccalesの群集構造と高穀類食に対するその応答【JST・京大機械翻訳】

The community structure of Methanomassiliicoccales in the rumen of Chinese goats and its response to a high-grain diet

著者 (3件)： Jin Wei (Jiangsu Province Key Laboratory of Gastrointestinal Nutrition and Animal Health; Laboratory of Gastrointestinal Microbiology, College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Cheng Yanfen (Jiangsu Province Key Laboratory of Gastrointestinal Nutrition and Animal Health; Laboratory of Gastrointestinal Microbiology, College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Zhu Weiyun (Jiangsu Province Key Laboratory of Gastrointestinal Nutrition and Animal Health; Laboratory of Gastrointestinal Microbiology, College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China)
資料名： Journal of Animal Science and Biotechnology (Web)  (Journal of Animal Science and Biotechnology (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 47  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7387A  ISSN： 2049-1891  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】新たに提案されたメタン生成次数(Methanomasilliicoccales)は,第一胃における2番目に大きい古細菌個体群であり,第2に,Methanobrevrevi個体群に対してのみである。しかしながら,第一胃におけるこの新しい順序のコミュニティに関する情報は限られている。【方法】本研究では,乾草(0%穀粒,n=5)または高穀粒(65%穀粒,n=5)飼料を与えた中国ヤギの第一胃におけるMethanomasilliicoccalesの豊度と群集組成を調査するためにリアルタイムPCRと454ピロシーケンスを用いた。【結果】リアルタイムPCR分析により,ヤギ第一胃におけるMethanomasilliicoccales(総古細菌の%)の相対存在量は,高穀物食群(0.5%±0.2%)において,食事群(8.2%±1.1%,P<0.05)におけるそれより有意に低いことを示した。ピロシーケンスの結果は,全部で208の操作分類単位(OTUs)が99%の配列同一性で10の試料から形成されたことを示した。すべての配列は,ファミリーレベルでMethanomasilliicoccaceaeと同定され,ほとんどの配列(96.82%±1.64%)は,RIM-DBデータベースに基づく各サンプルにおいて,Methanomasilliicoccales属レベルで8,9,および10グループに分類された。有意差は,hay-および高-穀物-食餌群の間でOTUsまたはChao1の数,ShannonのまたはPielouの均等性指数において観察されなかった(P≧0.05)。PCoA分析により,食事はMethanosassiioccalesのコミュニティを変化させることを示した。属レベルにおいて,グループ10(67.25±12.76対38.13±15.66,P=0.012)およびグループ4(2.07±1.30対0.27±0.30,P=0.035)の相対豊度は,高穀物食グループで有意に高かったが,グループ9の相対豊度は,食事グループで有意に高かった(18.82±6.20対47.14±17.72,P=0.020)。種レベルにおいて,グループ10種(67.25±12.76対38.13±15.66,P=0.012)およびグループ4種MPT1(2.07±1.30対0.27±0.30,P=0.035)の相対存在量は,高穀物食グループで有意に高かったが,グループ9種ISO4-G1の相対豊度は,hay-食餌グループで有意に高かった(12.83±3.87対42.44±18.47,P=0.022)。【結論】中国のヤギのルーメンにおけるMethanomasilliicoccalesコミュニティ内では,わずかに豊富な系統発生群が優勢であり,これらは高穀物食摂食により容易に抑制された。相対的に低い豊度は,中国のヤギの第一胃メタン生成に対するMethanomasilliicoccalesの部分への寄与が小さいことを示唆している。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  個体群 ,  乾草 ,  系統発生 ,  *穀類 ,  配列相同性 ,  リアルタイムPCR法 ,  コミュニティ ,  古細菌 ,  *中華人民共和国 ,  メタン化
準シソーラス用語： ピロシークエンス法 ,  有意差 ,  次数 ,  *群集構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： コミュニティ構造 ,  食事 ,  ヤギ ,  Methanomassiliiccales ,  ピロシークエンシング

分類 (3件)： 羊,山羊  (FD02050F) ,  微生物の生態  (EG03040J) ,  胃  (EJ06030C)

引用文献 (31件)：

• Int J Syst Evol Microbiol; Methanomassiliicoccus luminyensisgen nov., sp. nov., a methanogenic archaeon isolated from human faeces; B Dridi, ML Fardeau, B Ollivier, D Raoult, M Drancourt; 62; 8; 2012; 1902-1907; 10.1099/ijs.0.033712-0; CR1;
• Microbes Environ; Candidatus Methanogranum caenicola: a novel methanogen from the anaerobic digested sludge, and proposal of Methanomassiliicoccaceae fam. nov. and Methanomassiliicoccales ord. nov., for a methanogenic lineage of the class Thermoplasmata; T Iino, H Tamaki, S Tamazawa, Y Ueno, M Ohkuma, K Suzuki; 28; 2; 2013; 244-250; 10.1264/jsme2.ME12189; CR2;
• Appl Environ Microbiol; Structure of the archaeal community of the rumen; PH Janssen, M Kirs; 74; 12; 2008; 3619-3625; 10.1128/AEM.02812-07; CR3;
• Appl Environ Microbiol; Methanoplasmatales, Thermoplasmatales-related archaea in termite guts and other environments, are the seventh order of methanogens; K Paul, JO Nonoh, L Mikulski, A Brune; 78; 23; 2012; 8245-8253; 10.1128/AEM.02193-12; CR4;
• Animal; Diversity of gut methanogens in herbivorous animals; B St-Pierre, ADG Wright; 7; Suppl 1; 2013; 49-56; 10.1017/S1751731112000912; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 中国 ,  ヤギ ,  こぶ胃 ,  群集構造 ,  穀類 ,  応答