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J-GLOBAL ID：201802281201399235   整理番号：18A0805496

空間時間的トランスクリプトーム解析はLiliumの「小さなパドル」における二色性の発達への洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Spatiotemporal Transcriptome Analysis Provides Insights into Bicolor Tepal Development in Lilium “Tiny Padhye”

著者 (10件)： Xu Leifeng (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Yang Panpan (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Yang Panpan (Department of Ornamental Plants, College of Landscape Architecture, Nanjing Forestry University) ,  Feng Yayan (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Xu Hua (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Cao Yuwei (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Tang Yuchao (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Yuan Suxia (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Xinyan (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Ming Jun (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 398  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二色アジア雑種ユリ品種「Tiny Padhye」は,その独特の色パターンのために魅力的な品種であり,その二色花被片の発達中に,花被片は緑色から白色に変化するが,花被片は緑から紫に変化するが,これらの変化の基礎となる分子機構はほとんど特性化されていない。Lilium Tiny Padhyeの上部花被片(S2-U)と基底テp(S1-D,S2-D,s3-D,S4-D)から15のRNA-seqライブラリーを系統的に調べた。Illinaプラットフォームを利用して,合計295,787の単一遺伝子を713.12百万の高品質のpaired-end readから得た。合計16182個の単一遺伝子を,花被片発生の間に差次的に発現した遺伝子として同定した。GeneとGenomes経路分析の京都Encyclopediaを用いて,アントシアニン生合成経路(61の単一遺伝子)とクロロフィル代謝経路(106の単一遺伝子)に関与する候補遺伝子を同定した。更なる分析により,ほとんどのアントシアニン生合成遺伝子は花被片塩基において協調的に転写されたが,上部種皮においては転写されないことを示し,「Tiny Padhye」テpの二色形質がアントシアニン生合成遺伝子の転写調節により引き起こされることを示唆した。一方,クロロフィル分解遺伝子の高い発現レベルとクロロフィル生合成遺伝子の低い発現レベルは,開花後の「Tiny Padhye」テpからクロロフィルの不在をもたらした。ユリにおけるアントシアニン生合成経路とクロロフィル代謝に関与する転写因子を,重み付き遺伝子共発現ネットワーク分析を用いて同定し,ユリの二色花被片発生におけるそれらの可能な役割を考察した。結論として,これらの広範なトランスクリプトームデータは,ユリにおける二色テpの分子機構を解明するためのプラットフォームを提供し,他の密接に関連した種における類似の研究の基礎を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *トランスクリプトーム ,  クロロフィル ,  転写因子 ,  遺伝子 ,  代謝経路 ,  アントシアニン ,  *ユリ属 ,  品種 ,  キャラクタリゼーション ,  開花 ,  生合成
準シソーラス用語： 生合成遺伝子 ,  生合成経路 ,  花被 ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Lilium spp. ,  トランスクリプトーム ,  bicolor Tepals ,  アントシアニン生合成 ,  クロロフィル代謝 ,  転写ネットワーク

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトーム解析 ,  Lilium ,  パドル ,  二色性 ,  発達 ,  洞察