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J-GLOBAL ID：201802281445477805   整理番号：18A0934727

スプライセオソームプロファイリングによる機能的イントロンのトランスクリプトーム全体の疑問【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome-wide Interrogation of the Functional Intronome by Spliceosome Profiling

著者 (12件)： Chen Weijun (RNA Therapeutics Institute, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Chen Weijun (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Moore Jill (Bioinformatics and Integrative Biology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Moore Jill (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Ozadam Hakan (Program in Systems Biology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Shulha Hennady P. (Bioinformatics and Integrative Biology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Shulha Hennady P. (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Rhind Nicholas (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Weng Zhiping (Bioinformatics and Integrative Biology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Weng Zhiping (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Moore Melissa J. (RNA Therapeutics Institute, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA) ,  Moore Melissa J. (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA 01655, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 173  号： 4  ページ： 1031-1044.e13  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 真核生物トランスクリプトームの完全な理解とそれらが異なる条件にどのように応答するかは,イントロン切除のすべての部位の深い知識を必要とする。RNA配列決定(RNA-seq)はこの情報の多くを提供するが,多くのスプライシング転写物(しばしばそれらの急速な細胞質崩壊による)の低存在量はRNA-seq単独の能力を制限し,スプライシング種の完全レパートリーを明らかにする。ここでは,後期スプライセオソームによるRNA共精製の深い配列決定に基づく「スプライセオソームプロファイリング」を提示し,スプライセオソームプロファイリングにより,前例のない深さでの単一ヌクレオチド分解能と分岐点同定へのイントロン末端の明確なマッピングを可能にした。著者らのデータは,S.pombeにおける数百の新しいイントロンを明らかにし,スプライセオソーム集合と触媒作用ゲノム全体の直接的な検索サイトを提供することにより,リボソームプロファイリングは細胞質におけるmRNA翻訳の理解を変換した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Schizosaccharomyces pombe ,  高速度 ,  ヌクレオチド ,  真核生物 ,  分解能 ,  アノテーション ,  *スプライセオソーム ,  *トランスクリプトーム ,  細胞質 ,  *イントロン ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： *プロファイリング ,  触媒作用 ,  分岐点 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： スプライセオソームのプロファイリング ,  スプライセオソームの足跡 ,  RNA-seq ,  分岐点マッピング ,  イントロン注釈 ,  S.pombe

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (2件)： イントロン ,  トランスクリプトーム