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J-GLOBAL ID：201802281782787600   整理番号：18A1682593

シミュレートされた焼戻の無限スイッチング限界としての統合テンパリング強化サンプリング法【JST・京大機械翻訳】

Integrated tempering enhanced sampling method as the infinite switching limit of simulated tempering

著者 (4件)： You Zhiyi (Department of Statistics, University of California, Berkeley, California 94720, USA) ,  Li Liying (Courant Institute of Mathematical Sciences, New York University, New York, New York 10012, USA) ,  Lu Jianfeng (Department of Mathematics, Department of Physics, and Department of Chemistry, Duke University, Durham, North Carolina 27708, USA) ,  Ge Hao (Beijing International Center for Mathematical Research (BICMR) and Biodynamic Optical Imaging Center (BIOPIC), Peking University, Beijing 100871, People’s Republic of China)
資料名： Journal of Chemical Physics  (Journal of Chemical Physics)
巻： 149  号： 8  ページ： 084114-084114-8  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0275A  ISSN： 0021-9606  CODEN： JCPSA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高速で正確なサンプリング法は,分子動力学シミュレーションと実験観察の間の大きなギャップを橋渡しするために,高い要求にある。最近,統合テンパリング増強サンプリング(ITS)法が提案され,様々な生物物理学的例に適用され,立体配座サンプリングが著しく加速されている。その有効性に対する数学的検証はまだ解明されていない。ここでは,統合された焼戻し強化サンプリング法が,混合ポテンシャルに対するシミュレートされた焼戻し法の無限スイッチング限界の再定式化と見なすことができることを示した。さらに,シミュレーションしたテンパリング分子動力学の効率は,温度間のスイッチング周波数が増加すると,経験的分布の大きな偏差原理に基づいて改善されることを実証した。著者らの理論はITSの利点の理論的正当化を提供する。最後に,著者らは,いくつかの数値例を通して,無限スイッチングシミュレーションテンパリング法の有用性を例示した。Copyright 2018 AIP Publishing LLC All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 高速度 ,  生物物理学 ,  分子動力学 ,  定式化 ,  *焼戻 ,  立体配座 ,  *スイッチング ,  計算機シミュレーション
準シソーラス用語： スイッチング周波数 ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 物理化学一般  (CB01010X) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  反応速度論・触媒一般  (CB06010G)

タイトルに関連する用語 (8件)： 焼戻 ,  無限 ,  スイッチング ,  限界 ,  統合 ,  テンパリング ,  強化 ,  サンプリング