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J-GLOBAL ID：201802281828405032   整理番号：18A0967171

1年生メダカ,Austrofundulus limnaeusにおける表現型可塑性に対する母性的に暫定された手がかりのトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic analysis of maternally provisioned cues for phenotypic plasticity in the annual killifish, Austrofundulus limnaeus

著者 (2件)： Romney Amie L. (Department of Biology, Portland State University, Portland, USA) ,  Podrabsky Jason E. (Department of Biology, Portland State University, Portland, USA)
資料名： EvoDevo (Web)  (EvoDevo (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 6  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7053A  ISSN： 2041-9139  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】遺伝子型と環境は,極端な条件で生命を支える新しい適応特性を作り出すために,開発の間に相互作用することができる。胚は初期発生時に軸形成からエピbolを分離し,休眠として知られている代謝休眠の状態に入り,極端な環境条件に耐えることができるので,一年生のkil魚Austrobfundus limnnaeusの発達は脊椎動物の間でユニークである。休眠に入る能力は母性的にプログラムでき,若い雌は休眠に入らない胚を生産する。代わりに,胚は休眠から「脱出」にプログラムでき,母性因子と胚培養条件の両方により直接的に発達する。したがって,母性的に包装された遺伝子産物は,この種における発生的な軌跡およびおそらく他のユニークな発生特性を調節すると仮定されている。【結果】高スループットRNA塩基配列決定を用いて,A.limnaeusの1-2細胞期胚におけるmRNA,長い非コードRNAおよび小さい非コードRNA(sncRNA)のトランスクリプトームプロファイルを生成した。トランスクリプトーム解析により,オルタナティブスプライシングmRNA及びアンチセンスsncRNAによる胚の母性プログラミングを示唆し,これらの結果をゼブラフィッシュ及び他の魚類の比較研究の結果と比較した結果,両表現型で発現した遺伝子の軌跡特異的スプライス変異体の役割が示唆された。さらに,ゼブラフィッシュとの比較研究に基づいて,A.limnaeus1-2細胞期トランスクリプトームは独特の生活史と一致する方法でユニークである。これらの結果は,休眠への入口を調節する遺伝的機構の理解に影響を及ぼすだけでなく,発生時の遺伝子発現の後成的制御への洞察も提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *トランスクリプトーム ,  遺伝 ,  *表現型 ,  休眠 ,  選択的スプライシング ,  *母親 ,  遺伝子 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子型 ,  ヌクレオチド配列 ,  代謝 ,  ゼブラフィッシュ ,  相互作用 ,  mRNA
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 休眠 ,  母性効果 ,  母性から接合への移行 ,  トランスクリプトーム ,  RNA-seq ,  選択的スプライシング

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (120件)：

• J Exp Zool; The developmental biology of annual fishes I. Stages in the normal development of Austrofundulus myersi Dahl; JP Wourms; 182; 1972; 143-168; 10.1002/jez.1401820202; CR1;
• J Exp Zool; The developmental biology of annual fishes III. Pre-embryonic and embryonic diapause of variable duration in the eggs of annual fishes; JP Wourms; 182; 1972; 389-414; 10.1002/jez.1401820310; CR2;
• J Exp Zool; The developmental biology of annual fish II. Naturally occurring dispersion and reaggregation of blastomeres during the development of annual fish eggs; JP Wourms; 182; 1972; 169-200; 10.1002/jez.1401820203; CR3;
• EvoDevo; Gene expression patterns that support novel developmental stress buffering in embryos of the annual killifish Austrofundulus limnaeus; JT Wagner, JE Podrabsky; 6; 2015; 2; 10.1186/2041-9139-6-2; CR4;
• J Exp Biol; Alternative developmental pathways associated with diapause regulated by temperature and maternal influences in embryos of the annual killifish Austrofundulus limnaeus; JE Podrabsky, IDF Garrett, ZF Kohl; 213; 2010; 3280-3288; 10.1242/jeb.045906; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： メダカ ,  表現型可塑性 ,  母性 ,  手がかり ,  トランスクリプトーム解析