文献

J-GLOBAL ID：201802281865279458   整理番号：18A1006100

訓練計画中のアラビア馬血液のトランスクリプトームプロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome profiling of Arabian horse blood during training regimens

著者 (6件)： Ropka-Molik Katarzyna (Department of Genomics and Animal Molecular Biology, National Research Institute of Animal Production, Balice, Poland) ,  Stefaniuk-Szmukier Monika (Department of Horse Breeding, Institute of Animal Science, University of Agriculture in Cracow, Kracow, Poland) ,  Zukowski Kacper (Department of Animal Genetics and Breeding, National Research Institute of Animal Production, Balice, Poland) ,  Piorkowska Katarzyna (Department of Genomics and Animal Molecular Biology, National Research Institute of Animal Production, Balice, Poland) ,  Gurgul Artur (Department of Genomics and Animal Molecular Biology, National Research Institute of Animal Production, Balice, Poland) ,  Bugno-Poniewierska Monika (Department of Genomics and Animal Molecular Biology, National Research Institute of Animal Production, Balice, Poland)
資料名： BMC Genetics (Web)  (BMC Genetics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 31  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7366A  ISSN： 1471-2156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:アラビア馬は世界で最も古く最も影響力のあるウマ品種の1つと信じられている。血液は体ホメオスタシス維持に関与する主要組織であり,他の組織で起こる過程のマーカーと考えられている。したがって,著者らの研究の目的は,訓練計画を受けたアラビア馬の血液で起こる変化の遺伝的基礎を同定し,異なる訓練期間(T_1:調整期,T_2:強いギャロップ期後,T_3:競走期の終わり)と訓練および非訓練馬(T_0)の間の全体的遺伝子発現プロファイルを比較することであった。HiScanSQプラットフォーム(Illina)上に75bpの単一末端を持つ37試料についてRNA配列決定を行い,DESeq2(v1.11.25)ソフトウェアに基づいて差別的に発現した遺伝子(DEG)を同定した。【結果】その後の訓練期間のDEGの数の増加が観察された。そして,最も高い量のDEG(440)が,競走期(T_3)の終わりに,非訓練馬(T_0)と馬の間で検出された。T_2対T_3トランスクリプトームとT_0対T_3トランスクリプトームの比較は,長期運動(T_2とT_0と比較してT_3期間における266と389DEGのアップレギュレーション)の間,上方制御された遺伝子の有意な増加を示した。40の差次的に発現した遺伝子は,T_1とT_2期間の間で検出され,T_2とT_3の間で296であった。機能的アノテーションは,運動においてアップレギュレートされた最も豊富な遺伝子が,細胞周期(PI3K-Aktシグナル伝達経路),細胞コミュニケーション(cAMP依存経路),増殖,分化およびアポトーシス,ならびに免疫過程(Jak-STATシグナル伝達経路)を制御する経路に関与することを示した。結論:訓練が,平坦な人種において競合する適合性の調整と維持に対する適応の反映として,ウマ血液における永続的なトランスクリプトーム変化を引き起こすかどうかを調査した。本研究は,アラビア馬における長期運動時の体ホメオスタシス維持に必須な過剰発現分子経路と遺伝子を同定した。選択されたDEGは,アラビア馬における競走能力と潜在的に関連するマーカーとしてさらに研究されるべきである。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細胞周期 ,  コミュニケーション ,  遺伝子 ,  アノテーション ,  RNA【核酸】 ,  アップレギュレーション ,  遺伝 ,  アポトーシス ,  品種 ,  ソフトウェア ,  *トランスクリプトーム ,  適応性 ,  ホメオスタシス
準シソーラス用語： 過剰発現 ,  遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アラビア馬 ,  訓練 ,  血液トランスクリプトーム ,  RNA-seq ,  運動適応

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (46件)：

• J Appl Physiol; Adaptations of skeletal muscle to endurance exercise and their metabolic consequences; JO Holloszy, EF Coyle; 56; 1984; 831-38; CR1;
• J Appl Physiol; Determinants of time trial performance and maximal incremental exercise in highly trained endurance athletes; RA Jacobs, P Rasmussen, C Siebenmann, V Diaz, M Gassmann, D Pesta, E Gnaiger, NB Nordsborg, P Robach, C Lundby; 111; 2011; 1422-30; 10.1152/japplphysiol.00625.2011; CR2;
• Br J Sports Med; Fatigue and underperformance in athletes: the overtraining syndrome; R Budgett; 32; 1998; 107-10; 10.1136/bjsm.32.2.107; CR3;
• PM&R; Physiological and psychological fatigue in extreme conditions: overtraining and elite athletes; D Purvis, S Gonsalves, PA Deuster; 2; 5; 2010; 442-450; 10.1016/j.pmrj.2010.03.025; CR4;
• Comp Biochem Physiol Part D Genomics Proteomics; Differential expression of equine muscle biopsy proteins during normal training and intensified training in young standard bred horses using proteomics technology; FG Bouwman, MM Ginneken, JP Noben, E Royackers, E Graaf-Roelfsema, ID Wijnberg, JH Kolk, EC Mariman, E Breda; 5; 1; 2010; 55-64; 10.1016/j.cbd.2009.11.001; CR5;

タイトルに関連する用語 (3件)： 訓練計画 ,  アラビア ,  血液