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J-GLOBAL ID：201802282242486858   整理番号：18A0517721

DNA分解酵素シークエンシングにおける配列特異的バイアスを軽減するための新しい方法【Powered by NICT】

A new method for alleviating sequence-specific biases in DNase-seq

著者 (6件)： Xu Siwen (College of Automation, Harbin Engineering University, Harbin, Heilongjiang Province, China, 150001) ,  Wang Ying (College of Automation, Harbin Engineering University, Harbin, Heilongjiang Province, China, 150001) ,  Liu Huan (College of Automation, Harbin Engineering University, Harbin, Heilongjiang Province, China, 150001) ,  Chen Duojiao (College of Automation, Harbin Engineering University, Harbin, Heilongjiang Province, China, 150001) ,  Bi Hongyuan (College of Automation, Harbin Engineering University, Harbin, Heilongjiang Province, China, 150001) ,  Feng Weixing (College of Automation, Harbin Engineering University, Harbin, Heilongjiang Province, China, 150001)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2017  号： EIIS  ページ： 1-5  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNアーゼIフットプリント法は転写因子結合部位を認識するための確立された方法である。ハイスループットDNA分解酵素シークエンシングアレイは単一塩基対解像度でin vivoでのDNアーゼIフットプリントを表現するために使用されてきた。多くの異なった計算方法はDNA分解酵素シークエンシングフットプリント法による結合部位を予測するために開発した。しかし,DNアーゼIの開裂バイアスは予測精度に負の影響をもたらした。本研究では,この配列特異的バイアスの影響を低減する新しい方法を示した。実験検証部では,この手法を試験するためにSVMを使用し,良好な分類結果は,著者らの新しい方法の有効性を示した。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 分解能 ,  *バイアス ,  塩基対 ,  *DNアーゼ ,  結合部位 ,  フットプリント法
準シソーラス用語： 実験検証 ,  予測精度 ,  フットプリント ,  ハイスループット ,  転写因子結合部位 ,  デオキシリボヌクレアーゼI ,  *配列解析 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (3件)： DNA分解酵素 ,  シークエンシング ,  バイアス