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J-GLOBAL ID：201802282567040572   整理番号：18A0965847

GBSマーカーを用いたコムギにおける高密度連鎖地図の開発と3-PISTIL遺伝子(PIS1)のマッピング【JST・京大機械翻訳】

Development of a high-density linkage map and mapping of the three-pistil gene ( Pis1 ) in wheat using GBS markers

著者 (6件)： Yang Zaijun (Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation (Ministry of Education), College of Life Science, China West Normal University, Nanchong, China) ,  Chen Zhenyong (Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation (Ministry of Education), College of Life Science, China West Normal University, Nanchong, China) ,  Peng Zhengsong (Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation (Ministry of Education), College of Life Science, China West Normal University, Nanchong, China) ,  Yu Yan (Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation (Ministry of Education), College of Life Science, China West Normal University, Nanchong, China) ,  Liao Mingli (Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation (Ministry of Education), College of Life Science, China West Normal University, Nanchong, China) ,  Wei Shuhong (Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation (Ministry of Education), College of Life Science, China West Normal University, Nanchong, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 567  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】コムギ突然変異体系統3-雌til(TP)は,花弁当たり3つの雌性を示す。TPは通常,同じスパイク上の花弁の各々において2つまたは3つの種子を有するので,スパイク当たりの穀粒数を増加させる可能性がある。したがって,TPはコムギにおける育種および花の発達の研究のための非常に価値のある突然変異体である。F_2マッピング個体群(CM28×CM28TP)からの遺伝子型毎の一塩基多型(GBS-SNP)データを用いて,3-pistil遺伝子(PIS1)をマッピングするために,有意な価値のある遺伝子地図を構築した。【結果】本研究において,2917のGBS-SNPマーカーを含むコムギの高密度遺伝子地図を構築した。21の連鎖群は,2371.40cMの全長で分解された。個々の染色体は平均マーカー密度0.81cMで2.64cMから454.55cMの範囲であった。この高分解能マップを用いてPIS1遺伝子をマッピングし,遺伝子M70とM71に密接に結合した2つの隣接SNPマーカーを同定した。PI1はM70から3.00cm,M71から1.10cmである。パンコムギのゲノムにおいて,M70とM71は,127の蛋白質コード遺伝子を含む3.40Mbの物理的距離を区切ることが分かった。GIS生成遺伝子型データを検証し,PIS1領域における欠損マーカーデータを除去するために,5つの競合的対立遺伝子特異的PCR(KASP)アッセイを対応するGBS配列から設計した。3つのKASP-SNPマーカー,KM70,KM71およびKM75を,PIS1遺伝子領域に再マッピングした。【結論】本研究は,PIS1の地図ベースのクローン化のための基礎を築くだけでなく,コムギにおける重要な形質とマーカー支援育種のマーカー-形質関連を研究するための価値あるツールとしても役立つことができる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  個体群 ,  遺伝子型 ,  高分解能 ,  一塩基多型 ,  *遺伝子 ,  育種 ,  ゲノム ,  *連鎖地図 ,  *コムギ ,  遺伝子地図 ,  クローン
準シソーラス用語： パンコムギ ,  SNPマーカー ,  連鎖群 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： コムギ ,  遺伝子型決定(GBS) ,  3-PISTIL変異 ,  Kompetive対立遺伝子特異的PCR(KASP)

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (28件)：

• Plant Breed; Designing a wheat ideotype with increased sink capacity; S Dencic; 112; 1994; 311-317; 10.1111/j.1439-0523.1994.tb00689.x; CR1;
• Physiological and numerical components of wheat yield; Wheat ecology and physiologyof yield determination; JR Frederic, PJ Bauer; Food Products Press; 2000; 45-65; CR2;
• Euphytica; Chromosomal location of genes for supernumerary spikelet in bread wheat; ZS Peng, C Yen, JL Yang; 103; 1998; 109-114; 10.1023/A:1018323310621; CR3;
• Martinek P, Bednar J. Changes of spike morphology (multirowspike-MRS, long glumes-LG) in wheat (Triticum aestivum L.) and their importance for breeding, In: The proceedings of international conference ‘genetic collections, isogenic and alloplasmiclines’ Novosibirsk, Russia, 2001; 192-4.
• J Agron Crop Sci; A new mutation in wheat producing three pistils in a floret; ZS Peng; 189; 2003; 270-272; 10.1046/j.1439-037X.2003.00040.x; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： GBS ,  マーカー ,  コムギ ,  連鎖地図 ,  開発 ,  遺伝子 ,  マッピング