MC1R遺伝子多形部位と毛色相関分析【JST・京大機械翻訳】

Zhao Shanshan; Xiao Ning; Li Zhipeng; Pan Qingjie; Li Zhen; Shi Deshun; Liu Qingyou

文献

J-GLOBAL ID：201802282807705916 整理番号：18A1949809

MC1R遺伝子多形部位と毛色相関分析【JST・京大機械翻訳】

Correlation Analysis between the Polymorphism Loci of MC1R Gene and Coat Color in Horses

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資料名：
巻： 49 号： 8 ページ： 1605-1616 発行年： 2018年
JST資料番号： C2231A ISSN： 0366-6964 CODEN： CMHPAI 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

本研究の目的は,ウマの毛色育種のための重要な理論的参照を提供するために,MC1R遺伝子多型部位と馬毛色の関連性を研究することである。本研究では,10種の異なる毛色計132匹の頚静脈血を採集し,ゲノムを抽出し,PCR技術を用いてMC1R遺伝子のコード配列をクローンし,制限性長多型(RFLP)分析とシークエンシング分析を通じて,馬MC1R遺伝子多型と毛色との関係を分析した。また、SNPsがコードタンパク質の構造に与える影響を予測した。MC1R遺伝子の系統樹を構築した。その結果、馬MC1R遺伝子には3つの多型部位が存在し、そのうちc.G102Aは同義変異であり、c.C248Tとc.G250Aはミスセンス突然変異であることが分かった。c.C248TによるMC1R蛋白質の83番目のアミノ酸は極性の親水性セリンから非極性の疎水性フェニルアラニンに変化し、突然変異後、この部位のアミノ酸と第3膜貫通領域の127番目のアミノ酸(セリン)間の水素結合が消失し、MC1Rのタンパク質の構造が変化した。この突然変異はMC1R遺伝子のEE、Eeとeeの3種類の遺伝子型が現れた。ミスセンス突然変異c.G250Aは、その翻訳のアミノ酸がアスパラギン酸からアスパラギンに変化し、この部位の突然変異後、隣接アミノ酸及び膜貫通ドメインの作用力が複雑で、c.C248T突然変異のみがMC1Rタンパク質の機能に与える影響は小さいと推測し、この部位の突然変異は遺伝子型eeaを招いた。NCBI中のMC1R遺伝子型データ(571匹)と毛色形質の相関分析により,EEとEeの2つの遺伝子型が存在し,EE,Ee,eeとeea遺伝子型が,EeとEeの2つの遺伝子型に存在することを示した。栗毛にはeeとeeaの2つの遺伝子型が存在する。黒毛とliu毛馬の遺伝子型分布の差は非常に顕著(P<0.01)で、Hardy-Weinberg不平衡を呈し、対立遺伝子Eは優勢対立遺伝子であり、栗色馬ではE対立遺伝子が検出されず、eは優勢対立遺伝子であった。MC1R遺伝子系統の系統樹分析により、EE遺伝子型個体は家馬、普氏野馬との類似性が最も高かった。本研究の結果、馬MC1R多型部位が産生する異なる遺伝子型と馬の毛色、黒毛、栗毛及びこれらの3種類の毛色を基礎とする毛色の花馬毛色には相関性があり、liu毛馬と黒毛馬には遺伝子型eeが存在しなく、栗毛馬には等位遺伝子Eが存在しないことが分かった。遺伝子型の対馬の毛色の選択育種に基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学

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