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J-GLOBAL ID：201802282910173699   整理番号：18A0965999

ミトコンドリアゲノムは推定された無性性Fusarium oxysporum種複合体における組換えを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Mitochondrial genomes reveal recombination in the presumed asexual Fusarium oxysporum species complex

著者 (10件)： Brankovics Balazs (Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, The Netherlands) ,  Brankovics Balazs (Institute of Biodiversity and Ecosystem Dynamics, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Dam Peter van (Swammerdam Institute for Life Sciences, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Rep Martijn (Swammerdam Institute for Life Sciences, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Hoog G. Sybren de (Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, The Netherlands) ,  Hoog G. Sybren de (Institute of Biodiversity and Ecosystem Dynamics, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Lee Theo A. J. van der (Wageningen University and Research Centre, Wageningen, The Netherlands) ,  Waalwijk Cees (Wageningen University and Research Centre, Wageningen, The Netherlands) ,  Diepeningen Anne D. van (Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, The Netherlands) ,  Diepeningen Anne D. van (Wageningen University and Research Centre, Wageningen, The Netherlands)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 735  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:Fusarium oxysporum種複合体(FOSC)は,いくつかの系統発生系統を含む。系統発生研究により,FOSC内で2~3の主要クレードを同定した。ミトコンドリア配列は非常に有益な系統発生マーカーであるが,技術的困難さのためにほとんど無視されてきた。【結果】FOSC株の合計61個の完全なミトゲノムをde novoで組み立て,注釈した。長さ変化とイントロンパターンは,3つの系統発生種の分離を支持する。Fusarium属に典型的なミトゲノムの可変領域はFOSCに2つの新しい変異体を示す。Fusariumに典型的な変異体は全3クレードのメンバーに見られたが,変異体2はクレード2及び3において,変異3はクレード2においてのみ見出された。遺伝的一致種認識法の新しい実行を用いて解析した遺伝子座の拡張セットは,FOSC内の3つの系統発生種の同定を支持する。FOSCにおけるミトゲノムの比較分析は,系統発生種間ではなく,進行中のミトコンドリア組換えを明らかにした。【結論】組換えは,F.oxysporumにおけるパラasサイクルの存在を示す。ミトゲノムの利用を妨げる障害は,次世代配列決定とGRAbBのような選択的ゲノム集合体を用いることにより解決される。完全なミトゲノム配列は系統発生および集団遺伝学的研究のための安定した基礎および参照点を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 凝集体 ,  *ミトコンドリア ,  遺伝 ,  *Fusarium ,  系統発生 ,  *Fusarium oxysporum ,  変異 ,  *複合体 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  ゲノム配列 ,  比較分析 ,  可変領域 ,  クレード ,  *ミトコンドリアゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 比較ゲノミクス ,  ミトコンドリアゲノム ,  ミトコンドリア組換え ,  系統ゲノミクス

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (40件)：

• Phytopathology; Gene genealogies and AFLP analyses in the Fusarium oxysporum complex identify monophyletic and nonmonophyletic formae speciales causing wilt and rot disease; RP Baayen, K O’Donnell, PJM Bonants, E Cigelnik, LPNM Kroon, EJA Roebroeck, C Waalwijk; 90; 8; 2000; 891-900; 10.1094/PHYTO.2000.90.8.891; CR1;
• Mol Plant Pathol; Pathogen profile update: Fusarium oxysporum; CB Michielse, M Rep; 10; 3; 2009; 311-24; 10.1111/j.1364-3703.2009.00538.x; CR2;
• O’Donnell K, Sutton DA, Wiederhold N, Robert VARG, Crous PW, Geiser DM. Veterinary Fusarioses within the United States. J Clin Microbiol (Epub ahead of print). 2016. doi:10.1128/JCM.01607-16.
• Curr Clin Microbiol Rep; Taxonomy and Clinical Spectra of Fusarium Species: Where Do We Stand in 2014?; AD van Diepeningen, AMS Al-Hatmi, B Brankovics, GS de Hoog; 1; 1-2; 2014; 10-18; 10.1007/s40588-014-0003-x; CR4;
• Plant Dis; Nonpathogenic Fusarium oxysporum strain Fo47 induces resistance to Fusarium wilt in tomato,; JG Fuchs, Y Moënne-Loccoz, G Défago; 81; 5; 1997; 492-6; 10.1094/PDIS.1997.81.5.492; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： ミトコンドリアゲノム ,  推定 ,  Fusarium ,  複合体 ,  組換え