遺伝子型特異的PCRとディープシークエンシングにより決定したUKにおける混合遺伝子型C型肝炎ウイルス感染の有病率【JST・京大機械翻訳】

McNaughton A. L.; Sreenu V. B.; Wilkie G.; Gunson R.; Templeton K.; Leitch E. C. M.

文献

J-GLOBAL ID：201802283035983256 整理番号：18A0927517

遺伝子型特異的PCRとディープシークエンシングにより決定したUKにおける混合遺伝子型C型肝炎ウイルス感染の有病率【JST・京大機械翻訳】

Prevalence of mixed genotype hepatitis C virus infections in the UK as determined by genotype-specific PCR and deep sequencing

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資料名：
巻： 25 号： 5 ページ： 524-534 発行年： 2018年
JST資料番号： W2670A ISSN： 1352-0504 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

英国における混合遺伝子型C型肝炎ウイルス(HCV)感染の発生率はほとんど知られていない。直接作用する抗ウイルス薬の有効性は異なる遺伝子型にわたって変動するので,治療計画は感染遺伝子型に適合し,診断されていない混合遺伝子型HCV感染内の基礎遺伝子型の治療に対する問題を引き起こす可能性がある。従って,治療前に混合遺伝子型感染を正確に診断する必要がある。PCRに基づく診断ツールを開発し,これらの遺伝子型のいずれかと診断された506人の個体群において,最も一般的なUK遺伝子型,1aおよび3により引き起こされた混合遺伝子型感染の発生をスクリーニングした。混合感染の全体の罹患率は3.8%であった。しかしながら,この率は不均等に分布し,遺伝子型1a株を持つ遺伝子型3と診断された個体の6.7%,遺伝子型3を持つ遺伝子型1a患者からの試料のわずか0.8%であった(P<.05)。混合感染試料は主要およびマイナー遺伝子型から成り,後者は全ウイルス負荷の21%未満を構成し,67%の症例ではウイルス負荷の1%未満であった。Illina PCR次世代配列決定によるコホートのサブセットの分析は,PCRにより得られたよりもはるかに大きな発生率をもたらした。これは,技術の非定量的性質と負の対照に基づく偽陽性閾値の指定にもかかわらず,生じた可能性がある。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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動物の寄生虫病 , 微生物形態学・分類学 , 麦 , 個体群生態学 , 菌類による植物病害

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