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J-GLOBAL ID：201802283274735867   整理番号：18A0966401

霊長類におけるフィラグリン遺伝子反復領域の構造と進化【JST・京大機械翻訳】

Structure and evolution of the filaggrin gene repeated region in primates

著者 (9件)： Romero Vanessa (Department of Genetics, School of Life Sciences, Graduate University for Advanced Studies (SOKENDAI), Mishima, Japan) ,  Romero Vanessa (Division of Human Genetics, National Institute of Genetics, Mishima, Japan) ,  Hosomichi Kazuyoshi (Division of Human Genetics, National Institute of Genetics, Mishima, Japan) ,  Hosomichi Kazuyoshi (Present address: Department of Bioinformatics and Genomics, Graduate School of Medical Sciences, Kanazawa University, Kanazawa, Japan) ,  Nakaoka Hirofumi (Department of Genetics, School of Life Sciences, Graduate University for Advanced Studies (SOKENDAI), Mishima, Japan) ,  Nakaoka Hirofumi (Division of Human Genetics, National Institute of Genetics, Mishima, Japan) ,  Shibata Hiroki (Division of Genomics, Medical Institute of Bioregulation, Kyushu University, Fukuoka, Japan) ,  Inoue Ituro (Department of Genetics, School of Life Sciences, Graduate University for Advanced Studies (SOKENDAI), Mishima, Japan) ,  Inoue Ituro (Division of Human Genetics, National Institute of Genetics, Mishima, Japan)
資料名： BMC Evolutionary Biology (Web)  (BMC Evolutionary Biology (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 10  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7052A  ISSN： 1471-2148  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】反復配列の進化動力学は非常に複雑であり,いくつかは互いに分化しない。2つのモデルは,反復遺伝子協調および出生死のための複雑な進化過程を説明することができ,後者は選択によって維持される重複によって駆動される。反復領域におけるランダム複製と損失によって引き起こされるコピー数の変化は,分子経路を調節し,したがって,個体群における表現型特性に影響を及ぼす可能性があり,新しい環境に適応できる個体をもたらす。この研究では,哺乳類の皮膚の外層の重要な成分をコードするフィラグリン遺伝子(FLG)を調べ,種内と種内のコピー数の変化を示すタンデム反復を含む。このモデルがFLGの単一エキソン内の完全タンデム反復の進化経路に最も良く適合することを調べるために,カニ(Macaca fascicularis),Orangutan(Pongo abelii),ゴリラ(Gorilla gallilla),チンパンジー(Pan troglodytes)の反復配列を決定し,これらをヒト(Homo sapiens)の配列と比較した。【結果】本研究では,遺伝子コピーに一般的に使用されている協調および出生死進化モデルを比較した。著者らは,フィラグリン反復領域の間に高いヌクレオチド多様性があることを見出した。それは出生死モデルに適合する。系統発生分析により,独立した重複事象は,カニ摂食マカクとオランウータンにおける反復配列を作り出し,一方,異なる重複と損失イベントは,ゴリラ,チンパンジー,およびヒトにおける反復を作り出したことを示唆した。反復配列の比較により,種内の精製選択と種間の系統特異的重複を検出した。著者らはチンパンジーおよびカニ摂食マカクのような種内の反復領域の長さの変化も見出した。結論:霊長類間のFLGの反復配列におけるコピー数の変化は種特異的な発散と拡大の結果である可能性があると結論した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 個体群 ,  *遺伝子 ,  チンパンジー ,  ヒト ,  ゴリラ ,  オランウータン ,  表現型 ,  反復配列 ,  コピー数 ,  Macaca
準シソーラス用語： 系統解析 ,  *フィラグリン ,  縦列反復配列 ,  出生 ,  *フィラグリン遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： フィラグリン ,  コピー数変動 ,  出生と死の進化 ,  重複/損失

分類 (1件)： 個体群生態学  (EE03030S)

引用文献 (50件)：

• Annu Rev Genet; Concerted and birth-and-death evolution of multigene families; M Nei, A Rooney; 39; 2005; 121-52; 10.1146/annurev.genet.39.073003.112240; CR1;
• Genome Res; Highly efficient concerte evolution in the ribosomal DNA repeats: total rDNA repeat variation revealed by whole genome shotgun sequence data; R Austen, T Kobayashi; 17; 2007; 184-91; 10.1101/gr.5457707; CR2;
• Genome Dyn; The birth-and-death evolution of multigene families revisited; J Eirín-López, L Rebordinos, A Rooney, J Rozas; 7; 2012; 170-96; 10.1159/000337119; CR3;
• BMC Evol Biol; Rapid birth-and-death evolution of the xenobiotic metabolizing NAT gene family in vertebrates with evidence of adaptive selection; A Sabbagh, J Marin, C Vyssiére, E Lecompte, S Boukouvala, ES Poloni, P Darlu, B Crouau-Roy; 13; 2013; 62; 10.1186/1471-2148-13-62; CR4;
• J Invest Dermatol; One remarkable molecule: filaggrin; S Brown, W Irwin; 132; 2012; 751-62; 10.1038/jid.2011.393; CR5;

タイトルに関連する用語 (4件)： 霊長類 ,  フィラグリン遺伝子 ,  反復 ,  進化