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J-GLOBAL ID：201802283352989801   整理番号：18A0206596

ブロイラーにおける脂質二方向選択系におけるRNA編集サイトの同定研究【JST・京大機械翻訳】

Identification of RNA Editing Sites in Chicken Lines Divergently Selected for Abdominal Fat Content

著者 (5件)： Liang Hao (東北農業大学動物科学技術学院,農業部鶏遺伝育種重点実験室,黒竜江省教育庁動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜150030) ,  Li Min (東北農業大学動物科学技術学院,農業部鶏遺伝育種重点実験室,黒竜江省教育庁動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜150030) ,  Dong Xiangyu (東北農業大学動物科学技術学院,農業部鶏遺伝育種重点実験室,黒竜江省教育庁動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜150030) ,  Li Hui (東北農業大学動物科学技術学院,農業部鶏遺伝育種重点実験室,黒竜江省教育庁動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜150030) ,  Du Zhiqiang (東北農業大学動物科学技術学院,農業部鶏遺伝育種重点実験室,黒竜江省教育庁動物遺伝育種与繁殖重点実験室,哈爾浜150030)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 48  号： 9  ページ： 1611-1623  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,脂肪組織におけるRNAの編集部位情報を正確に得ることであり,脂肪関連研究のためのより多くの情報源を提供することである。本研究では、東北農業大学のブロイラーの高い、低い脂肪の双方向の選択菌株の第十九代のブロイラーを試験材料とし、トランスクリプトーム配列決定(RNA-seq)とゲノム配列決定データを用いて、ブロイラーの腹部脂肪組織のRNA編集部位を識別した。生物情報学の手段により,厳密なデータフィルタリングとスクリーニング戦略を設定し,RNA編集サイト候補セットを構築した。結果によると、候補の集中において、RNA編集部位の分類と注釈により、低脂肪系ブロイラーの脂肪組織において、転換型RNA編集サイト28個、トランスフォーム型RNA編集サイト101個があり、欠失型RNA編集サイト71個が挿入された。高脂肪系ブロイラーの脂肪組織において、転換型RNA編集サイト30個、トランス型RNA編集サイト84個、欠失型RNA編集サイト77個を挿入した。大部分のRNA編集部位はイントロン,遺伝子間領域および遺伝子上流領域(イントロン領域41.91%,遺伝子間領域33.08%,遺伝子下流259%,遺伝子上流2.94%および外部優性領域1.47%)に位置していた。4つの候補RNAの編集部位を試験し,3つの遺伝子座が脂肪形成に重要な関係があるA TP1B3,SLC6 A6およびFLNB遺伝子領域に位置していることを示した。本研究では、ブロイラーの脂肪組織中に存在するRNAの編集部位を同定し、検証し、RNAの編集が脂肪組織の生長発育に影響する分子メカニズムをさらに研究するために基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ブロイラー ,  イントロン ,  トランスクリプトーム ,  *脂質 ,  遺伝子 ,  *編集 ,  *RNAエディティング ,  スクリーニング ,  リポゲネシス ,  脂肪組織 ,  *RNA【核酸】 ,  内臓脂肪
準シソーラス用語： 分子機構 ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： broiler ,  adipose tissue ,  transition and transversion ,  InDel ,  RNA editing

分類 (1件)： 鶏  (FD03020F)

タイトルに関連する用語 (5件)： ブロイラー ,  脂質 ,  RNA編集 ,  同定 ,  研究