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J-GLOBAL ID：201802283536987232   整理番号：18A1071996

結腸直腸癌における静的および時系列Wntシグナリング測定のためのHilbert-SchmidtおよびSobol感度指数【JST・京大機械翻訳】

Hilbert-Schmidt and Sobol sensitivity indices for static and time series Wnt signaling measurements in colorectal cancer - part A

著者 (1件)： Sinha Shriprakash (Faculty of Maths & IT, Royal Thimphu College, Thimphu, Bhutan)
資料名： BMC Systems Biology (Web)  (BMC Systems Biology (Web))
巻： 11  号： 1  ページ： 120  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7370A  ISSN： 1752-0509  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Wingless[Sharma R.P.,Drosophila情報サービス,1973,50,p134]の偶発的発見以来,Wntシグナル伝達経路の分野における研究は,経路の高度な計算モデル化における最近の進歩により拡大された湿潤研究室実験および種々の癌臨床試験において重要な条項を取った。情報に富む遺伝子発現プロファイルは,シグナル伝達経路の様々な側面を明らかにし,同時に異なる問題を研究するのに役立つ。これまで,これらの問題の同時研究を組み込んだ多くの計算研究は存在しない。本論文では,シグナル伝達経路における寄与因子の強度を調べ,以前の生物学的知識に基づいて経路に影響する細胞間/細胞外因子間の既存因果関係を分析し,最近見出された経路で働く精神物理学の罹患率の変化を調べた。この目的を達成するために,密度(Hilbert-Schmidt情報基準)と分散(Sobol)に基づく感度指標を用いて,静的および時系列表現プロファイルから得られた因子間の(非)線形応答について局所的および大域的感度解析を行った。これらの結果は,高次元空間における経路の様々なイントラ/細胞外因子間の非線形関係を捉える再生産カーネルHilbert空間(RKHS)による距離測度とカーネルトリックの採用により,分散ベースの指標を用いた密度ベースの指標を用いる利点を示した。時系列データにおいて,これらの指標を用いて,他の因子の濃度の変化がなされるので,この指標が経路に影響を与えるかどうかを観察することが可能である。以前の生物学的知識,高次元空間における感度解析および表現のこの相乗効果は,標的治療薬の時間ベース投与を容易にし,結腸直腸癌試料内の隠れた生物学的情報を明らかにすることができる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 高次元 ,  感度解析 ,  相乗作用 ,  湿潤 ,  情報サービス ,  臨床試験 ,  投与 ,  因果律 ,  分子標的療法 ,  *ショウジョウバエ
準シソーラス用語： Kernel法 ,  再生産 ,  伝達経路 ,  *Wntシグナル ,  *結腸直腸癌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Wnt経路 ,  感度解析 ,  カーネル ,  心理法 ,  大腸癌 ,  システム生物学 ,  時系列データ

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (122件)：

• Drosophila Inf Serv; Wingless a new mutant in drosophila melanogaster; R Sharma; 50; 1973; 134-4; citation_id=CR1
• Neoplasia; Genetic and epigenetic changes of components affecting the wnt pathway in colorectal carcinomas stratified by microsatellite instability; L Thorstensen, GE Lind, T Løvig, CB Diep, GI Meling, TO Rognum, RA Lothe; 7; 2; 2005; 99-108; 10.1593/neo.04448; citation_id=CR2
• Nat Med; Wnt signaling in bone homeostasis and disease: from human mutations to treatments; R Baron, M Kneissel; 19; 2; 2013; 179-92; 10.1038/nm.3074; citation_id=CR3
• Cell; Wnt/[ β]-catenin signaling in development and disease; H Clevers; 127; 3; 2006; 469-80; 10.1016/j.cell.2006.10.018; citation_id=CR4
• Sokol S. Wnt Signaling in Embryonic Development, vol 17: Elsevier; 2011.

タイトルに関連する用語 (4件)： 結腸直腸癌 ,  時系列 ,  Wntシグナリング ,  感度指数