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J-GLOBAL ID：201802283677359494   整理番号：18A1296313

特異的長増幅断片配列決定に基づく高密度遺伝地図の開発と栽培ナンキンマメにおける収量関連形質の量的形質遺伝子座分析への応用【JST・京大機械翻訳】

Development of a High-Density Genetic Map Based on Specific Length Amplified Fragment Sequencing and Its Application in Quantitative Trait Loci Analysis for Yield-Related Traits in Cultivated Peanut

著者 (10件)： Wang Zhihui (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Huai Dongxin (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Zhaohua (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Cheng Ke (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Kang Yanping (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wan Liyun (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Yan Liying (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Jiang Huifang (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Lei Yong (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Liao Boshou (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 9  ページ： 827  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高密度遺伝子地図(HDGM)はゲノム研究と量的形質遺伝子座(QTL)マッピングに非常に有用である。しかしながら,ナンキンマメにおけるDNA多型の低頻度は,利用可能なマーカーの量を制限し,HDGMの構築を妨げた。本研究は,特異的遺伝子座増幅フラグメント配列決定(SLAF-seq)技術と新たに構築されたRIL集団(「ZH16」×「sd-H1」)に基づく最高数の高品質SNPを持つナンキンマメ遺伝子地図を作成した。構築されたHDGMは,20の連鎖群(LG)上の2,636のビンに属する3,630のSNPマーカーを含み,それは,平均マーカー距離0.58cMで,長さ2,098.14cMをカバーした。このHDGMを,ナンキンマメにおける再結合率と分離歪を含むゲノム特性化の,以下の共線比較,足場固定および分析に適用した。調査した14の収量関連形質のQTLマッピングのために,全部で62のQTLが3つの環境を通して12の染色体上に検出され,QTLの共局在が表現型に有意に相関したこれらの形質に対して観察された。種子および莢関連形質に対する2つの安定した共局在QTLは,それぞれB06およびB07の染色体末端において有意に同定された。本研究における収量関連形質に対するHDGMおよびQTL分析の構築は,遺伝子の微細マッピングおよび機能解析ならびに分子マーカー支援育種に対する有用な情報を提供する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 表現型 ,  キャラクタリゼーション ,  *ナンキンマメ ,  育種 ,  機能分析 ,  *量的形質遺伝子座 ,  *遺伝子 ,  *栽培 ,  ゲノム
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  微細マッピング ,  QTL解析 ,  連鎖群 ,  DNA多型 ,  ゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ナンキンマメ ,  高密度遺伝地図 ,  SLAF-seq ,  QTL解析 ,  歩留り

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (11件)： 増幅 ,  断片 ,  遺伝地図 ,  開発 ,  栽培 ,  ナンキンマメ ,  収量 ,  形質 ,  量的形質遺伝子座 ,  分析 ,  応用