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J-GLOBAL ID：201802283908400919   整理番号：18A0922881

EDNAメタバーコーディングと従来の観測法を用いた河川魚の多様性の地域規模と地域規模の推定の比較【JST・京大機械翻訳】

Comparing local- and regional-scale estimations of the diversity of stream fish using eDNA metabarcoding and conventional observation methods

著者 (6件)： Nakagawa Hikaru (Field Science Education and Research Center, Kyoto University, Kyoto, Japan) ,  Yamamoto Satoshi (Department of Zoology, Graduate School of Science, Kyoto University, Kyoto, Japan) ,  Sato Yukuto (The Ryukyu University, Okinawa, Japan) ,  Sado Tetsuya (Natural History Museum and Institute, Chiba, Japan) ,  Minamoto Toshifumi (Graduate School of Human Development and Environment, Kobe University, Kobe, Japan) ,  Miya Masaki (Natural History Museum and Institute, Chiba, Japan)
資料名： Freshwater Biology  (Freshwater Biology)
巻： 63  号： 6  ページ： 569-580  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0030C  ISSN： 0046-5070  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大規模モニタリングにおけるこの技術の潜在的有効性,限界及び将来の修復を調べるために,河川魚種の局所的及び地域的多様性を調べるために,Mifi-U/Eプライマーを用いた環境DNA(eDNA)代謝の性能評価を示した。著者らは,eDNA推定が河川水の方向性流れにより下流より上流で観測された魚群集とより一貫していると仮定した。本州島の中央部の琵琶湖周辺の51河川の102地点で河川水を採取し,10日以内に日本,eDNAから推定した魚種組成と既存の観測データを比較した。観測サイトは,河川軌道に沿った水サンプリングサイトの一定距離(緩衝域)内の観測データから選択した。上流の集合に対するeDNAの検出バイアスの仮説を,観測データ,より高い標高からのデータ,およびより低い標高からのデータとの結果を比較することによって試験した。Jaccard非類似性指数を,観測データとバッファ範囲に対するeDNA推定値の間でプロットした。最小非類似性を有するバッファ範囲を選択した。eDNAサンプリングサイトの6km上流の既存の観測データを用いると,eDNAの結果は観測データと最も一致し,報告された種の86.4%(38/44)を示した。eDNAの結果は,関連種の既知の上流-下流ターンオーバー及びある種の生物地理的集合パターンと一致するパターンを示した。メタコード化技術を用いた10日間の調査により,より多くの時間,金銭および労働を通して得られた蓄積観測データとして上流バイアスによるeDNA検出の仮説パターンを含む多くの地域魚類多様性データを得ることができた。偽陽性/陰性検出に関する問題を著者らの調査において示唆した。しかし,これらは,サンプリング方法と将来の研究における実験手順を修正することによって,減少または除去されなければならない。したがって,この新しいツールは,年間,季節的またはより細かい時間スケールでのデータにより,交差国や全地球モニタリングのような,決して実行されていないモニタリングを可能にすると結論した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 河川水 ,  推定量 ,  性能評価 ,  地理学 ,  *河川 ,  魚群 ,  日本 ,  バイアス ,  標高 ,  緩衝帯 ,  魚種組成 ,  琵琶湖 ,  魚種
準シソーラス用語： 非類似性 ,  *地域規模 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 集合パターン ,  環境DNA ,  メタバーコーディング ,  MIFISHプライマ ,  河川魚

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  水質調査測定一般  (SB02060X)

タイトルに関連する用語 (7件)： EDNA ,  メタバーコーディング ,  観測 ,  河川 ,  多様性 ,  地域規模 ,  推定