文献

J-GLOBAL ID：201802283943196852   整理番号：18A1114666

3つのデンマークのブタ品種における立体配座形質に関するゲノムワイド関連研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide association study for conformation traits in three Danish pig breeds

著者 (5件)： Le Thu H. (Department of Molecular Biology and Genetics, Center for Quantitative Genetics and Genomics, Aarhus University, Tjele, Denmark) ,  Le Thu H. (Department of Animal Breeding and Genetics, Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, Sweden) ,  Christensen Ole F. (Department of Molecular Biology and Genetics, Center for Quantitative Genetics and Genomics, Aarhus University, Tjele, Denmark) ,  Nielsen Bjarne (SEGES Pig Research Centre, Copenhagen, Denmark) ,  Sahana Goutam (Department of Molecular Biology and Genetics, Center for Quantitative Genetics and Genomics, Aarhus University, Tjele, Denmark)
資料名： Genetics Selection Evolution (Web)  (Genetics Selection Evolution (Web))
巻： 49  号： 1  ページ： 12  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7383A  ISSN： 1297-9686  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:音の立体配座に対する選択は,ブタにおける跛行と下肢の弱さを低減するための主要なアプローチとして広く用いられている。立体配座形質に影響を及ぼすゲノム領域の同定は,これらの低い遺伝的形質に対する選択精度を改善するのに役立つであろう。本研究の目的は,メタ分析に続くゲノムワイド関連研究を実施することにより,3つのデンマークのブタ品種における脚および背の立体配座特性の根底にある遺伝的因子を同定することであった。【方法】3つのデンマークのブタ品種(23,898のランドレース,24130のヨークシャーおよび16524のデュロックブタ)のための4つの立体配座特性(前脚,背,後脚および全体の立体配座)に関するデータを,関連分析のために使用した。単一形質関連分析からの単一ヌクレオチド多型(SNP)の推定効果を2つのメタ分析において組み合わせた。(1)品種内に多面的な遺伝的変異体があるかどうかを調べるために,複数の形質に対する種内メタ分析;そして,(2)同じ量的形質遺伝子座(QTL)が品種を横切って分離するかどうかを調べるために,単一形質のための交配種メタ分析を行った。SNPアノテーションは,候補遺伝子を探索するために,Ensembl上のSus scrofa Build 10.2を通して実行された。結果:3つの品種に対する単一形質関連分析で検出された14,12および13QTLの間で,最も有意なSNPは,ランドレースにおけるバック品質の遺伝的分散の2,2.3および11.4%を説明した。これらのQTLに対するいくつかの候補遺伝子も同定された。すなわち,LRPPRC,WRAP73,VRTNおよびPPARDは,骨および筋肉発生の調節を介して立体配座特性を制御し,IGF2BP2,GH1,CCND2およびMSH2は成長関連過程を通して影響を持つことができる。メタ分析は,より高い有意性レベルを有する単一形質分析から多くの有意なSNPを確認するだけでなく,いくつかの付加的関連SNPを検出し,可能な多面的効果を有するQTLを示唆した。【結論】著者らの結果は,立体配座特性が複雑であり,骨と骨格の発達,筋肉と脂肪代謝,および成長過程に関与する遺伝子によって部分的に制御される可能性があることを意味する。QTLと候補遺伝子の信頼できるリストを提供し,ブタにおける立体配座特性を改善するための微細マッピングとマーカー支援選択に使用できる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アノテーション ,  *立体配座 ,  メタ分析 ,  *ゲノム ,  遺伝 ,  *デンマーク王国 ,  下肢 ,  品質 ,  成長段階 ,  一塩基多型 ,  *品種 ,  量的形質遺伝子座 ,  脂質代謝
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  ランドレース , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 豚  (FD02040U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (64件)：

• Livest Sci; Impact of lameness and claw lesions in sows on welfare, health and production; M Heinonen, O Peltoniemi, A Valros; 156; 2013; 2-9; 10.1016/j.livsci.2013.06.002; CR1;
• Livest Prod Sci; Associations between lying-down behaviour problems and body condition, limb disorders and skin lesions of lactating sows housed in farrowing crates in commercial sow herds; M Bonde, T Rousing, JH Badsberg, JT Sørensen; 87; 2004; 179-187; 10.1016/j.livprodsci.2003.08.005; CR2;
• J Anim Breed Genet; Genetic association between leg conformation in young pigs and sow longevity; TH Le, P Madsen, N Lundeheim, K Nilsson, E Norberg; 133; 2016; 283-290; 10.1111/jbg.12193; CR3;
• J Anim Sci; Developmental factors that influence sow longevity; MD Hoge, RO Bates; 89; 2011; 1238-1245; 10.2527/jas.2010-3175; CR4;
• J Anim Sci; Genetic associations for gilt growth, compositional, and structural soundness traits with sow longevity and lifetime reproductive performance; MT Nikkilä, KJ Stalder, BE Mote, MF Rothshild, FC Gunsett; 91; 2013; 1570-1579; 10.2527/jas.2012-5723; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： デンマーク ,  ブタ ,  品種 ,  立体配座 ,  形質 ,  ゲノム ,  研究