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J-GLOBAL ID：201802284028300344   整理番号：18A1824331

膵癌特異的発現lncRNAに関するceRNA調節ネットワークの構築【JST・京大機械翻訳】

Construction of pancreatic cancer specific lncRNA-associated ceRNA network

著者 (4件)： He Jiangyang (鄭州大学第二附属医院普通外科 鄭州450014) ,  Li Fengxi (广西国際壮医医院普通外科 南寧530021) ,  Huang Chuiguo (鄭州大学第二附属医院泌尿外科 鄭州450014) ,  Niu Yueping (鄭州大学第二附属医院普通外科 鄭州450014)
資料名： Zhengzhou Daxue Xuebao (Yixue Ban)  (Zhengzhou Daxue Xuebao (Yixue Ban))
巻： 53  号： 4  ページ： 457-462  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3561A  ISSN： 1671-6825  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】膵臓癌の特異的長鎖非コードRNA(lncRNA)の競合的内因性RNA(ceRNA)調節ネットワークを構築する。方法;TCGAデータベースから178個の膵臓癌と4個の正常膵臓サンプルのRNA発現スペクトルデータ及び相応する臨床資料をダウンロードし、差次的に発現したlncRNA、miRNAとmRNAを比較分析した。lncRNA-miRNAオンライン予測ツールmiRcodeデータベース及びmiRNAターゲット遺伝子予測データベース(miRDB、miRTarBase、TargetScan)に基づいて選別した。lncRNAに関連するceRNA調節ネットワークを構築した。ネットワーク中のキーln-cRNAと相応するターゲット遺伝子に対して生存分析を行った。結果;12のlncRNA,5つのmiRNA,54のmRNA,KEGGシグナル伝達経路,およびGOの機能分析を含む,膵臓癌の特異的lncRNA関連のceRNA調節ネットワークの構築に成功した。標的遺伝子は主に”TNFsig-nalingpathway””Jak-STATsignalingpathway””Apoptosismultiplespecies””MAPKsignalingpathway”などの通路に濃縮されている。“cellu-larprocess””biologicalregulation””regulationofcellularprocess”などの機能と密接な関係がある。生存分析の結果,lncRNAMIR600HR,C9orf139,RP11-796E2.4,AC104809.2,および標的遺伝子CDHR1,CYFIP2,IL10RA,MAP3K1,SSH2,およびCDHR1が同定された。TSPAN1、VAMP1は、膵臓癌の予後と密接な関係がある。結論:膵臓癌の特異的lncRNA関連のceRNA調節ネットワークの構築に成功し、膵臓癌の診断、治療と予後評価に潜在的な標的を提供する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： mRNA ,  予測 ,  機能分析 ,  *ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *膵臓腫瘍 ,  データベース
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  KEGG ,  *cRNA ,  オンライン ,  マイクロRNA ,  *遺伝子調節ネットワーク ,  *非翻訳長鎖RNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 膵癌 ,  発現 ,  lncRNA ,  ceRNA ,  調節ネットワーク ,  構築