文献

J-GLOBAL ID：201802284389000978   整理番号：18A1200386

イネいもち病菌Magnaporこの oryzaeにおけるappresorium発生における役割を持つ新規遺伝子を同定するためのネットワーク抽出オントロジーの利用【JST・京大機械翻訳】

Using Network Extracted Ontologies to Identify Novel Genes with Roles in Appressorium Development in the Rice Blast Fungus Magnaporthe oryzae

著者 (1件)： Ames Ryan M. (Wellcome Trust Centre for Biomedical Modelling and Analysis, Living Systems Institute, University of Exeter, Stocker Road, Exeter, EX4 4QD, UK)
資料名： Microorganisms (Web)  (Microorganisms (Web))
巻： 5  号： 1  ページ： 3  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7248A  ISSN： 2076-2607  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Magnapor oryzaeはイネいもち病の原因菌であり,世界中のイネの最も重要な感染である。世界人口の半分は,その一次カロリー摂取のための米に依存し,イネいもち病は食品安全保障に重大な脅威をもたらす。M.oryzae感染の段階は良く定義されており,植物クチクラの侵入を可能にする細胞型である付着器の形成により,特に良く研究されている。しかし,この疾患段階に関与する多くの重要な経路と遺伝子はまだ同定されていない。本研究では,RNA-Seqデータから推論された階層構造のネットワーク抽出オントロジー(NeXOS)を用いて,この過程における潜在的役割を持つ新規遺伝子を明らかにした。本研究は,大規模ゲノミクスデータからの経路同定のためのNeXOSの使用を例証し,また,疾患における潜在的役割を有する新規遺伝子を同定する。ここで提示した方法は他の病原性種における疾患過程の研究に有用であり,これらのデータはM.oryzaeにおける介入のための新規標的の予測を示す。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  *オントロジー ,  階層構造 ,  遺伝子発現 ,  *イネいもち病菌 ,  RNA【核酸】 ,  感染 ,  病原性 ,  *遺伝子 ,  食品安全性 ,  植物病原菌 ,  クチクラ
準シソーラス用語： 付着器 ,  起因菌 ,  *イネいもち病 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Magnaporこの oryzae ,  イネいもち病 ,  真菌病原菌 ,  植物病原菌 ,  ネットワーク ,  遺伝子発現 ,  RNA-seq

分類 (2件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  稲作  (FC03020C)

引用文献 (56件)：

• Ou, S. Pathogen variability and host resistance in rice blast disease. Annu. Rev. Phytopathol. 1980, 18, 167-187.
• Khush, G.S. What it will take to feed 5.0 billion rice consumers in 2030. Plant Mol. Biol. 2005, 59, 1-6.
• Dean, R.A.; Talbot, N.J.; Ebbole, D.J.; Farman, M.L.; Mitchell, T.K.; Orbach, M.J.; Thon, M.; Kulkarni, R.; Xu, J.R.; Pan, H.; et al. The genome sequence of the rice blast fungus Magnaporthe grisea. Nature 2005, 434, 980-986.
• Dean, R.; Van Kan, J.A.; Pretorius, Z.A.; Hammond-Kosack, K.E.; Di Pietro, A.; Spanu, P.D.; Rudd, J.J.; Dickman, M.; Kahmann, R.; Ellis, J.; et al. The Top 10 fungal pathogens in molecular plant pathology. Mol. Plant Pathol. 2012, 13, 414-430.
• Wilson, R.A.; Talbot, N.J. Under pressure: Investigating the biology of plant infection by Magnaporthe oryzae. Nat. Rev. Microbiol. 2009, 7, 185-195.

タイトルに関連する用語 (5件)： イネいもち病菌 ,  役割 ,  遺伝子 ,  同定 ,  オントロジー