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J-GLOBAL ID：201802284424667931   整理番号：18A0965660

低温に応答したレイシ葉のトランスクリプトームプロファイリングは,花誘導中の候補調節遺伝子と重要な代謝事象を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome profiling of litchi leaves in response to low temperature reveals candidate regulatory genes and key metabolic events during floral induction

著者 (5件)： Zhang Hongna (College of Horticulture, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Zhang Hongna (Key Laboratory of Tropical Fruit Biology (Ministry of Agriculture), South Subtropical Crops Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Zhanjiang, China) ,  Shen Jiyuan (College of Horticulture, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Wei Yongzan (Key Laboratory of Tropical Fruit Biology (Ministry of Agriculture), South Subtropical Crops Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Zhanjiang, China) ,  Chen Houbin (College of Horticulture, South China Agricultural University, Guangzhou, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 363  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Litchi(Litchi chinensis Sonn)は亜熱帯地域で広く栽培されている経済的に重要な常緑果樹である。低温はレイシの花誘導に絶対的に必要であるが,その分子機構は完全には理解されていない。Litchi platidの葉は,花の誘導の間に重要な役割を果たし,低温知覚の部位である可能性がある。従って,葉を異なる温度(15°C/25°C)下で処理し,低温度誘導遺伝子発現変化を調べるために,de novo集合とデジタル遺伝子発現(DGE)プロファイリング分析のために葉試料を用いて高スループットRNA配列決定(RNA-Seq)を行った。【結果】83,107RNA-Seq単遺伝子は,1221bpの平均長さでde novo集合し,これらの単一遺伝子の約61%(50,345)は,公開蛋白質データベースに対してアノテーションされた。対照群と比較して低温処理下の分化発現遺伝子(DEG)は,著者らの研究の主な焦点であった。階層的クラスタリング分析は,花の誘導の間に3つの有意な発現クラスタ(p値≦0.05)を有する8つのグループに2755のDEGを配置した。糖と澱粉の含有量の増加とともに,糖の代謝に関与する遺伝子の発現は低温誘導後に劇的に増加した。また,1つのFT遺伝子(Unigene0025396,LcFT1)は,「florigen」と呼ばれる蛋白質を産生し,LitchiのDEGの間で検出された。LcFT1は明らかな特異的組織を示し,その発現は低温誘導後に高度に増加し,GUS染色結果はLcFT1遺伝子プロモーターにより駆動されたGUS活性も低温により誘導され,LcFT1は低温下でレイシの花誘導において重要な役割を果たすことを示した。結論:本研究は,ライチにおける低温誘導に応答した葉の変化の基礎となる分子機構をより良く理解するためのトランスクリプトームの全体的な調査を提供する。トランスクリプトームプロファイルと生理学的指標の分析は,亜熱帯常緑植物における花誘導の複雑な代謝を研究する助けとなる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 亜熱帯 ,  生理学 ,  クラスタ ,  *代謝 ,  *遺伝子 ,  プロモーター領域 ,  *低温 ,  *トランスクリプトーム ,  レイシ属 ,  遺伝子発現 ,  アノテーション ,  澱粉 ,  RNA【核酸】 ,  タンパク質
準シソーラス用語： *プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： レイシ(Litchi chinensis Sonn.) ,  花の誘導 ,  トランスクリプトーム ,  特異的発現遺伝子(DEG) ,  低温 ,  葉

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (66件)：

• Acta Hort; A phase approach towards floral formation in lychee; HB Huang, HB Chen; 665; 2003; 185-194; CR1;
• Sci Hortic; The effect of temperature on growth and dry matter production of lychee seedlings; CM Menzel, BF Paxton; 26; 1; 1985; 17-23; 10.1016/0304-4238(85)90097-4; CR2;
• J Hortic Sci Biotech; Effect of temperature on growth and flowering of litchi (Litchi chinensis Sonn.) cultivars; CM Menzel, DR Simpson; 63; 2; 1988; 349-360; CR3;
• J Hortic Sci Biotech; Effects of temperature and leaf water stress on growth and flowering of litchi (Litchi chinensis Sonn.); CM Menzel, TS Rasmussen, DR Simpson; 58; 1989; 75-82; CR4;
• Aust J Plant Physiol; Floral induction in growing buds of lychee (Litchi chinensis) and mango (Mangifera indica); DJ Batten, CA Mcconchie; 22; 5; 1995; 783-791; 10.1071/PP9950783; CR5;

タイトルに関連する用語 (9件)： 低温 ,  応答 ,  レイシ ,  葉 ,  花 ,  誘導 ,  調節遺伝子 ,  代謝 ,  事象