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J-GLOBAL ID：201802284619472808   整理番号：18A0475402

MDシミュレーションと動力学変動ネットワークを用いたHIV RT関連RNアーゼのためのキノリン阻害剤のアロステリック機構【Powered by NICT】

Allosteric mechanism of quinoline inhibitors for HIV RT-associated RNase with MD simulation and dynamics fluctuation network

著者 (4件)： Cai Yi (Shanghai High School, Shanghai, China) ,  Liu Hao (State Key Laboratory of Microbial Metabolism, Department of Bioinformatics and Biostatistics, National Experimental Teaching Center for Life Sciences and Biotechnology, College of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Chen Haifeng (State Key Laboratory of Microbial Metabolism, Department of Bioinformatics and Biostatistics, National Experimental Teaching Center for Life Sciences and Biotechnology, College of Life Sciences and Biotechnology, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Chen Haifeng (Shanghai Center for Bioinformation Technology, Shanghai, China)
資料名： Chemical Biology & Drug Design  (Chemical Biology & Drug Design)
巻： 91  号： 3  ページ： 805-816  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1436A  ISSN： 1747-0277  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト免疫不全ウイルス(HIV)は,人体のTリンパ球に感染すると免疫不全を起こすレトロウイルスである。逆転写酵素阻害剤(RTI)はRTのいくつかの機能を阻害し,ウイルス合成(二本鎖DNA)を防止できるので,HIVウイルスの複製は減少させることができる。実験結果はHIVウイルスの逆転写を阻害するHIV RT関連RNアーゼを標的とするベンゾイミダゾール系阻害剤のシリーズを示した。しかし,アロステリック機構はまだ不明である。ここで,分子動力学シミュレーションおよび動力学変動ネットワーク解析は阻害剤とRT関連RNアーゼとの間の結合モードを明らかにした。最も活性な分子は低活性阻害剤よりもより疎水性と静電相互作用を持っている。動力学相関ネットワーク解析が最も活性な阻害剤はRT関連RNアーゼのネットワークを混乱させ,ノードの相関を減少させることを示した。3D-QSARモデルは二種のロバストで信頼性のあるモデルを構築し,検証した独立した試験セットであったことを示唆した。3D-QSARモデルは,かさ高い負荷電または親水性置換基が生物活性に有利であることを示した。これらの結果は,キノリン阻害剤のアロステリック機構を明らかにし,生物活性を改善するのに役立つ。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 三次元 ,  *ネットワーク ,  計算機シミュレーション ,  定量的構造活性相関 ,  *RNアーゼ ,  *アロステリック効果 ,  ロバスト性 ,  *HIV【ウイルス】 ,  T細胞 ,  生物活性 ,  静電相互作用 ,  親水性 ,  疎水性 ,  逆転写
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  *阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 3D-QSAR ,  アロステリック機構 ,  HIV逆転写酵素 ,  腐食抑制剤 ,  MDシミュレーション

分類 (1件)： 抗ウイルス薬の基礎研究  (GW17040O)

タイトルに関連する用語 (8件)： MDシミュレーション ,  動力学 ,  HIV ,  RT ,  RNアーゼ ,  キノリン ,  阻害剤 ,  アロステリック機構