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J-GLOBAL ID：201802284649327249   整理番号：18A1196544

一般的な増幅と次世代シークエンシングは,トルコ,アナトリアにおけるクリミア-コンゴ出血熱ウイルスAP92様株と異なるマダニ静脈ウイルスを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Generic amplification and next generation sequencing reveal Crimean-Congo hemorrhagic fever virus AP92-like strain and distinct tick phleboviruses in Anatolia, Turkey

著者 (15件)： Dincer Ender (Mersin University, Advanced Technology Education, Research and Application Center, Mersin, Turkey) ,  Brinkmann Annika (Robert Koch Institute; Center for Biological Threats and Special Pathogens 1 (ZBS-1), Berlin, Germany) ,  Hekimoglu Olcay (Faculty of Science, Department of Biology, Division of Ecology, Hacettepe University, Ankara, Turkey) ,  Hacioglu Sabri (Faculty of Veterinary Medicine, Department of Virology, Ankara University, Ankara, Turkey) ,  Foldes Katalin (Faculty of Veterinary Medicine, Department of Virology, Ankara University, Ankara, Turkey) ,  Karapinar Zeynep (Faculty of Veterinary Medicine, Department of Virology, Yuzuncu Yil University, Van, Turkey) ,  Polat Pelin Fatos (Faculty of Veterinary Medicine, Department of Internal Medicine, Harran University, Sanliurfa, Turkey) ,  Oguz Bekir (Faculty of Veterinary Medicine, Department of Virology, Yuzuncu Yil University, Van, Turkey) ,  Kilinc OEzlem Orunc (Yuzuncu Yil University, Ozalp Vocational School, Van, Turkey) ,  Hagedorn Peter (Robert Koch Institute; Center for Biological Threats and Special Pathogens 1 (ZBS-1), Berlin, Germany) ,  OEzer Nurdan (Faculty of Science, Department of Biology, Division of Ecology, Hacettepe University, Ankara, Turkey) ,  OEzkul Aykut (Faculty of Veterinary Medicine, Department of Virology, Ankara University, Ankara, Turkey) ,  Nitsche Andreas (Robert Koch Institute; Center for Biological Threats and Special Pathogens 1 (ZBS-1), Berlin, Germany) ,  Erguenay Koray (Robert Koch Institute; Center for Biological Threats and Special Pathogens 1 (ZBS-1), Berlin, Germany) ,  Erguenay Koray (Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Virology Unit, Hacettepe University, Ankara, Turkey)
資料名： Parasites & Vectors (Web)  (Parasites & Vectors (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 335  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7341A  ISSN： 1756-3305  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Tickは,有意な健康影響を有するいくつかのウイルスの伝達に関与している。ダニ媒介ウイルス感染の発生率が上昇しているので,最近,いくつかの新規で分岐したダニ関連ウイルスが世界中で存在し,循環することが報告されている。本研究はトルコのいくつかの地域におけるすべての主要なダニ媒介ウイルスに対する横断的スクリーニングとして実施した。次世代配列決定(NGS)をウイルスゲノム特性化に用いた。2014~2016年の間に,Age,Thrace,地中海,黒海,中部,南部および東部地域を横切る14の省の43の場所でダニを収集した。形態学的同定に続いて,ダニ類はFlaviviridae属,ナウイルス属,Phlebovirus属,Flaviviridae属,およびBunyaviridae属に属するウイルスの一般的な核酸増幅によってプールされ,分析され,選択された標本において配列決定とNGSが続いた。【結果】13のダニ種から成る合計814の標本を収集し,187のプールで評価した。ナウイルスとフェレボウイルス分析は,6(3.2%)と48(25.6%)プールで陽性であった。すべてのナイオウイルス配列は,CCHFV株AP92と密接に関連しており,関連株間で系統発生的に異なるクラスターを形成していた。CCHFVゲノムセグメントの大部分はNGSにより得られた。Phlebovirusシークエンシングは,新規クレードと同様に,以前に特性化されたANTIGONE,Lesvos,KarmaおよびBoleダニウイルスを含むいくつかのダニ関連ウイルスクレードを明らかにした。ダニ関連ウイルス株に対するより広い宿主範囲が観察された。NGSはANTIGONEとKarmaクレードのLゲノムセグメントのほぼ完全な配列を提供し,ANTIGONE部分Sセグメントも提供した。CCHFVとKarmaまたは新しいphlebovirusクレードの共感染は,標本の2.1%で検出された。【結論】様々なダニ関連のフェレボウイルスクレードの広域循環は,Anatoliaにおいて初めて記録された。CCHFV AP92株のゲノムは,以前に調査されていない場所で同定された。NGSはANTIGONEとKarmaウイルスの今日までの最も詳細なゲノム特性化を提供した。疫学的および健康関連の結果は解明されなければならない。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ウイルス感染 ,  キャラクタリゼーション ,  クラスタ ,  疫学 ,  核酸 ,  *静脈 ,  系統発生 ,  地中海 ,  *トルコ共和国 ,  ゲノム ,  スクリーニング
準シソーラス用語： 健康 ,  クレード ,  *配列解析 ,  *マダニ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： ダニ ,  クリミア-コンゴ出血熱ウイルス ,  静脈ウイルス ,  AP92 ,  ナイロウイルス ,  次世代シークエンシング ,  監視 ,  アナトリア ,  トルコ

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (70件)：

• Trends Parasitol; Ticks and tick-borne diseases: a one health perspective; F Dantas-Torres, BB Chomel, D Otranto; 28; 2012; 437-446; 10.1016/j.pt.2012.07.003; CR1;
• Lancet; Drivers, dynamics, and control of emerging vector-borne zoonotic diseases; AM Kilpatrick, SE Randolph; 380; 2012; 1946-1955; 10.1016/S0140-6736(12)61151-9; CR2;
• Zootaxa; The Argasidae, Ixodidae and Nuttalliellidae (Acari: Ixodida) of the world: a list of valid species names; AA Guglielmone, RG Robbins, DA Apanaskevich, TN Petney, A Estrada-Pena, IG Horak; 2538; 2010; 1-28; CR3;
• Parasitology; The global importance of ticks; F Jongejan, G Uilenberg; 129; 2004; S3-S14; 10.1017/S0031182004005967; CR4;
• Clin Microbiol Infect.; Tick-borne virus diseases of human interest in Europe; RN Charrel, H Attoui, AM Butenko, JC Clegg, V Deubel, TV Frolova; 10; 2004; 1040-55; 10.1111/j.1469-0691.2004.01022.x; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： 増幅 ,  次世代シークエンシング ,  トルコ ,  アナトリア ,  クリミア-コンゴ出血熱ウイルス ,  株 ,  静脈 ,  ウイルス