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J-GLOBAL ID：201802284886235033   整理番号：18A0480089

細胞蛋白質RNA折畳みを安定化することを用いたモデルこみ合い剤と非標準的相互作用を持つソフト相互作用【Powered by NICT】

Soft Interactions with Model Crowders and Non-canonical Interactions with Cellular Proteins Stabilize RNA Folding

著者 (8件)： Daher May (Single Molecule Analysis Group, Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA) ,  Daher May (Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA) ,  Widom Julia R. (Single Molecule Analysis Group, Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA) ,  Widom Julia R. (Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA) ,  Tay Wendy (Single Molecule Analysis Group, Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA) ,  Tay Wendy (Program in Chemical Biology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA) ,  Walter Nils G. (Single Molecule Analysis Group, Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA) ,  Walter Nils G. (Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109-1055, USA)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 430  号： 4  ページ： 509-523  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生細胞は多様な生体高分子を含み,不均一密集環境の影響はRNA折畳みにほとんど理解されていないを形成した。,クラウディング剤としてポリエチレングリコールと酵母細胞抽出物の影響を検討するモデルとしてのヘアピンリボザイムの三次構造形成をモニターするために単一分子蛍光共鳴エネルギー移動を用いた。予想されたように,ポリエチレングリコールはリボザイムの結合,触媒的に活性な状態を安定化させ,一部排除体積効果を通して予想外に,さらにリボザイムによるソフト,非特異的相互作用を示すという証拠を見出した。酵母抽出物は細胞内に見られるより1000倍低い蛋白質濃度で折畳みに大きな影響を及ぼし,体積排除での特異的相互作用の優位性を示唆した。ゲルシフトアッセイと親和性プルダウンとそれに続く質量分析はリボザイム折畳みを安定化する多数の非標準的RNA結合蛋白質を同定した;これら遍在する蛋白質の見かけのシャペロン活性は細胞の低対イオン環境を補償した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： RNA結合タンパク質 ,  酵母 ,  三次構造 ,  ポリエチレンオキシド ,  親和性 ,  *相互作用 ,  *タンパク質 ,  質量分析 ,  リボザイム ,  *折畳み ,  生体高分子 ,  *こみあい効果 ,  *RNA【核酸】
準シソーラス用語： 単一分子 ,  *RNA折畳み , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ヘアピンリボザイム ,  単一分子蛍光共鳴エネルギー移動 ,  分子こみ合い ,  一過性RNA-蛋白質相互作用 ,  ポリエチレングリコール

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (9件)： 細胞 ,  蛋白質 ,  RNA折畳み ,  安定化 ,  モデル ,  こみ合い ,  標準 ,  相互作用 ,  ソフト