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J-GLOBAL ID：201802284943386753   整理番号：18A1618282

APPONパイプラインによるアポフェリチンの処理【JST・京大機械翻訳】

Processing apoferritin with the Appion pipeline

著者 (3件)： Stagg Scott M. (Institute of Molecular Biophysics, 91 Chieftain Way, Florida State University, Tallahassee, FL 32306, United States) ,  Stagg Scott M. (Department of Chemistry and Biochemistry, 95 Chieftain Way, Florida State University, Tallahassee, FL 32306, United States) ,  Mendez Joshua H. (Department of Physics, 77 Chieftan Way, Tallahassee, FL 32306, United States)
資料名： Journal of Structural Biology  (Journal of Structural Biology)
巻： 204  号： 1  ページ： 85-89  発行年： 2018年 
JST資料番号： W0838A  ISSN： 1047-8477  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 3DEM地図チャレンジは,単一粒子低温EMデータを処理するための異なるアルゴリズムとワークフローをテストする機会を提供した。著者らは,著者らが他のchallengラーよりも類似またはより良い分解能を達成するために,最小の手動介入で標準的なアプリオンワークフローを使用することができるかどうかを試験することに関心を持った。試験に関心を持つもう一つの疑問は,粒子選別と除去の影響が,3D再構成の分解能と品質に及ぼすことである。アポフェリチンは歴史的に単一粒子再構成のための挑戦的な粒子であり,元の地図挑戦データの著者らはデータセットに存在する粒子の一部のみを用いたので,著者らは著者らの侵入に対するアポフェリチンのデータセットに焦点を当てた。25844の粒子から3.7Åの地図を提出し,53,334の粒子から3.6Åの地図を提出し,評価後に,提出したアポフェリチン地図の中で最良であった。ここでは,著者らの再構成戦略の詳細を提示し,著者らの戦略を他の高スコア化アポフェリチン地図のそれと比較した。全体として,著者らの結果は,junの除去後に可能な限り多くの粒子を含む比較的立体的に均一な粒子が最も高い分解能をもたらすことを示唆し,カスタムマスク生成のパラメータの選択は3D再構成の分解能における微妙ではあるが有意な変化をもたらす可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分級 ,  *アポフェリチン ,  再構成 ,  分解能 ,  アルゴリズム ,  低温 ,  ワークフロー ,  品質 ,  応用プログラム
準シソーラス用語： スコア化 ,  3D画像再構成 ,  単一粒子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Cryo-EM ,  地図の挑戦 ,  最善の実践 ,  単一粒子再構成

分類 (2件)： 生体の顕微鏡観察法  (EA03050C) ,  図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (2件)： パイプライン ,  アポフェリチン