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J-GLOBAL ID：201802285169989353   整理番号：18A1351706

迅速臨床ヒト白血球抗原タイピングのためのイオンTorrent配列技術の評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of Ion Torrent sequencing technology for rapid clinical human leucocyte antigen typing

著者 (6件)： Guerra Sandra G. (National Histocompatibility and Immunogenetics Service Development Laboratory, National Health Service Blood and Transplant (NHSBT), London, UK) ,  Chong Winnie (National Histocompatibility and Immunogenetics Service Development Laboratory, National Health Service Blood and Transplant (NHSBT), London, UK) ,  Brown Colin J. (Histocompatibility and Immunogenetics Laboratory, National Health Service Blood and Transplant (NHSBT), London, UK) ,  Brown Colin J. (Faculty of Life Sciences and Medicine, King College London, London, UK) ,  Navarrete Cristina V. (National Histocompatibility and Immunogenetics Service Development Laboratory, National Health Service Blood and Transplant (NHSBT), London, UK) ,  Navarrete Cristina V. (Division of Infection and Immunity, University College London, London, UK)
資料名： International Journal of Immunogenetics  (International Journal of Immunogenetics)
巻： 45  号： 4  ページ： 230-235  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1475A  ISSN： 1744-3121  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト白血球抗原(HLA)領域を定義する技術の開発は,その高レベルの多型性のために困難であることが証明されている。臨床検査室内では,迅速で費用対効果が高い高分解能HLAタイピングの技術が不可欠である。NGSは,他のタイピング法で見られるHLAあいまいさの数を減少させた,迅速で高分解能のHLAタイピングソリューションを提供した。本研究では,1つのLambda NX型 NGSキットを,イオントレントPGMプラットフォーム上でテストした。4つの民族集団(ヨーロッパ人,南アジア人,アフリカ人および中国人)からの合計362人の登録ドナーは,9つの遺伝子座(HLA-A,-B,-C,-DRB1,-DRB345-DQB1および-DPB1)を横切って分類されたNGS HLAであった。歴史的PCR-SSO HLA型と比較したとき,91%-98%の一致率(HLA-A,-B,-C,-DRB1,-DQB1および-DPB1)が得られ,A*24:07:01およびC*04:82のような珍しい対立遺伝子の同定が観察された。44試料を分類するために,4日のターンアラウンド時間を達成した。しかし,いくつかの限界が観察された。プライマー位置は,Exon IおよびIV増幅が必要なHLAクラスII(HLA-DRB1*04:07:01/04:92,HLA-DRB1*09:01:02/*09:21,HLA-DRB1*12:01:01/*12:10)に対して,すべてのあいまいさを解決することができなかった。本研究は,NGSによる高分解能タイピングが臨床検査室に対して許容できるターンアラウンド時間で達成できることを示した。しかしながら,イオントレントワークフローは,対処すべきいくつかの技術的限界を持っている。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ドナー ,  ターンアラウンド時間 ,  対立遺伝子 ,  遺伝学 ,  *ヒト白血球抗原 ,  民族 ,  高分解能 ,  曖昧さ ,  HLA-A ,  南アジア
準シソーラス用語： *HLAタイピング ,  中国人 ,  *タイピング ,  アフリカ人 ,  ヨーロッパ人 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (11件)： コホート研究(前向き)研究 ,  病気 ,  遺伝学 ,  組織適合 ,  ヒト白血球抗原 ,  分子 ,  分子生物学 ,  NGS ,  研究 ,  技術 ,  タイピング

分類 (5件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  移植免疫  (ED03020E) ,  抗原・抗体・補体の生化学  (ED04020L) ,  腫ようの免疫療法  (GE03035B) ,  血液の腫よう  (GK04000M)

タイトルに関連する用語 (4件)： 臨床 ,  ヒト白血球抗原タイピング ,  イオン ,  評価