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J-GLOBAL ID：201802285417737609   整理番号：18A0800937

病変を含むDNAの構造と動力学に対するH3とH4ヌクレオソーム尾部の相乗効果 GG-ner認識のためのH3尾部への変位病変パートナー塩基の結合【JST・京大機械翻訳】

Synergistic effects of H3 and H4 nucleosome tails on structure and dynamics of a lesion-containing DNA: Binding of a displaced lesion partner base to the H3 tail for GG-NER recognition

著者 (6件)： Cai Yuqin (Department of Biology, New York University, 100 Washington Square East, New York, NY, 10003, USA) ,  Fu Iwen (Department of Biology, New York University, 100 Washington Square East, New York, NY, 10003, USA) ,  Geacintov Nicholas E. (Department of Chemistry, New York University, 100 Washington Square East, New York, NY, 10003, USA) ,  Zhang Yingkai (Department of Chemistry, New York University, 100 Washington Square East, New York, NY, 10003, USA) ,  Zhang Yingkai (NYU-ECNU Center for Computational Chemistry at NYU Shanghai, Shanghai 200062, China) ,  Broyde Suse (Department of Biology, New York University, 100 Washington Square East, New York, NY, 10003, USA)
資料名： DNA Repair  (DNA Repair)
巻： 65  ページ： 73-78  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1339A  ISSN： 1568-7864  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヌクレオソームにおけるDNA損傷がグローバルゲノムヌクレオチド除去修復(GG-NER)に対してどのように認識されているかはほとんど理解されておらず,ヒストン尾部が果たす役割は確立されていない。ヒストンH3およびH4 N末端尾部は,それらのアセチル化状態が転写,複製および修復におけるヌクレオソーム機能の調節に重要であるので,特に興味がある。特に,H3尾部は,XPC,GG-NER病変認識因子との相互作用の部位として最近注目されている。ここでは,環境発癌物質ベンゾ[a]ピレン(B[a]P)から誘導されたDNA損傷cis-b[a]P-dGの構造と動力学が,隣接するH3とH4尾部の存在により影響されることを調べた。この病変はGG-NERにより良く修復され,病変パートナーCが主溝に置換される塩基置換/インターカレーション立体配座を採用する。分子動力学シミュレーションを用いて,ヌクレオソームDNAに位置するこの病変に対する構造的および動的特性化を得て,それがH3およびH4尾部によりブラケットされるようにした。H4尾部は非アセチル化及びアセチル化状態で研究されたが,H3尾部はアセチル化されず,それがXPC(Kakumu,Nakanishiら,2017)に結合した時,その状態は非アセチル化された。アセチル化により,H4尾部がDNA表面から放出されることを明らかにした。その後,H3尾部は,置換された病変パートナーベースCのフリップと捕捉を誘導するポケットを形成する。これは2つの尾部の挙動の相乗効果を明らかにした。著者らは,H3尾部の二重能力が,置換された病変パートナー塩基を感知し,XPCを結合することが,ヌクレオソームにおけるGG-NERの開始のために,XPCによるこの病変の認識を促進できると仮定する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： インターカレーション ,  相互作用 ,  *ヌクレオソーム ,  *相乗作用 ,  発癌物質 ,  *DNA【核酸】 ,  塩基対置換 ,  立体配座 ,  アセチル化 ,  ヒストン ,  DNA損傷
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  ヒストンH3 ,  ヌクレオチド除去修復 ,  *病巣 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ヌクレオソームコア粒子 ,  ヒストン尾部 ,  リジンアセチル化 ,  DNA付加物 ,  MDシミュレーション ,  ヌクレオチド除去修復

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (9件)： 病変 ,  DNA ,  動力学 ,  ヌクレオソーム ,  尾部 ,  相乗効果 ,  変位 ,  パートナー ,  塩基