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J-GLOBAL ID：201802285595811111   整理番号：18A1293899

草食動物腸共生体Lactobacillus reuteriの比較ゲノミクスは遺伝的多様性とライフスタイル適応を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genomics of the Herbivore Gut Symbiont Lactobacillus reuteri Reveals Genetic Diversity and Lifestyle Adaptation

著者 (14件)： Yu Jie (Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Yu Jie (Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Zhao Jie (Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Zhao Jie (Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Song Yuqin (Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Song Yuqin (Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Zhang Jiachao (Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Zhang Jiachao (Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Yu Zhongjie (Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Yu Zhongjie (Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Zhang Heping (Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Zhang Heping (Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Sun Zhihong (Key Laboratory of Dairy Biotechnology and Engineering, Ministry of Education, Inner Mongolia Agricultural University) ,  Sun Zhihong (Key Laboratory of Dairy Products Processing, Ministry of Agriculture, Inner Mongolia Agricultural University)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 1151  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Lactobacillus reuteriは,脊椎動物の腸共生生物の生態学と進化を記述するモデルとして用いられているカタラーゼ陰性,グラム陽性,非運動性,偏性ヘテロ発酵性細菌種である。しかしながら,草食動物の胃腸管からのL.reuteriの遺伝的特徴と進化戦略は不明のままである。従って,中国,内モンゴルのヤギ,ヒツジ,ウシ,ウマから分離した16のL.reuteri株を本研究で配列した。比較ゲノムアプローチを用いて遺伝的多様性を評価し,21の公表されたゲノム配列に基づいて異なる宿主に関連する特徴を識別するための洞察を得た。異なる宿主からのL.reuteri株のゲノムサイズ,G+C含有量および平均ヌクレオチド同一性値は,株が広い遺伝的多様性を有することを示した。37のL.reuteri株の汎ゲノムは8680の遺伝子ファミリーを含み,コアゲノムは726の遺伝子ファミリーを含んだ。全部で92,270のヌクレオチド突然変異部位が37のL.reuteri株の間で発見され,すべてのコア遺伝子は1よりはるかに低いK_a/K_s比を示し,強い精製選択圧(負の選択)を示唆した。草食動物分離株で示されたコア遺伝子に基づく高度にロバストな最尤法ツリーを3つのクレードに分割した。クレードAとBはほとんどの草食動物分離株を含み,ヒト分離株とより密接に関連し,クレードCとはかなり異なっていた。いくつかの機能的遺伝子は,草食動物,雑食およびサワードウ群の宿主特異性に起因する可能性がある。さらに,細胞表面蛋白質と活性炭水化物酵素をコードする遺伝子の数は宿主特異的であった。本研究は,草食動物の腸の生息場所へのL.reuteriの適応に関する新しい洞察を提供し,異なる生態学的起源からのL.reuteriのゲノム多様性がそれらの生活環境と密接に関連していることを示唆している。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *乳酸桿菌属 ,  カタラーゼ ,  ヌクレオチド ,  突然変異 ,  ゲノム ,  生態学 ,  生息場所 ,  遺伝子 ,  ヒト ,  胃腸管 ,  *遺伝
準シソーラス用語： クレード ,  ゲノム配列 ,  *草食動物 ,  *Lactobacillus reuteri , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Lactobacillus reuteri ,  草食動物 ,  比較ゲノミクス ,  宿主特異的遺伝子 ,  細胞接着 ,  炭水化物活性酵素

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A)

タイトルに関連する用語 (8件)： 動物 ,  腸 ,  共生体 ,  Lactobacillus ,  比較ゲノミクス ,  遺伝的多様性 ,  ライフスタイル ,  適応