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J-GLOBAL ID:201802286803668014   整理番号:18A0583329

非固有種を発見するためのMetabarcodingと後サンプリング戦略:ビスケー中南部湾の河口域における事例研究【Powered by NICT】

Metabarcoding and post-sampling strategies to discover non-indigenous species: A case study in the estuaries of the central south Bay of Biscay
著者 (7件):
資料名:
巻: 42  ページ: 67-74  発行年: 2018年 
JST資料番号: W3272A  ISSN: 1617-1381  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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河口は同程度の大きさの他の地域よりもより多くの有機材料を生成する高生産的生息環境は,森林,牧場や農地など。これら地域は人間活動によって最も影響されるので,それらは高い生物多様性と宿主関連種,リスクに曝されているを示した。本研究では,環境DNA(eDNA)とmetabarcoding分析した水産食品生産(Ria del EoとRiade Villaviciosa,Asturias,北スペイン)において重要であることをビスケー湾内の二河口で実施した。主な目標は,非固有種の導入を検出するためのこれらの新しいツールの可能性を評価することであった。これら河口における外来貝培養を通して導入された可能性を外来属は,限定されたサンプリングにもかかわらず検出された。NISのうち,Crepidula fornicataは既にスペイン侵入種カタログ()で含まれていることが唯一のものであった。metabarcoding研究による初期侵入種検出後,ポストNGSサンプリングと古典的DNAバーコーディングを行い,それらをこれらの河口域における高度に侵襲性の種C.fornicataの存在を確認した。metabarcodingはまだいくつかの欠点,ユニバーサルPCRプライマーの欠如とデータベース中の全ての化学種について参照配列と同様に頻繁な偽陽性などを持っているが,それはこれらの重要な生態系のモニタリングと管理を容易にすることができる強力なツールであることを示し,特に,種発生を確認するためにポストNGSサンプリングを伴っているか否か。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
生態系  ,  海洋汚濁 

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