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J-GLOBAL ID：201802286906758651   整理番号：18A1293610

進化分析はHCVの起源と適応への洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Evolutionary Analysis Provides Insight Into the Origin and Adaptation of HCV

著者 (9件)： Forni Diego (Bioinformatics Laboratory, Scientific Institute IRCCS E.Medea) ,  Cagliani Rachele (Bioinformatics Laboratory, Scientific Institute IRCCS E.Medea) ,  Pontremoli Chiara (Bioinformatics Laboratory, Scientific Institute IRCCS E.Medea) ,  Pozzoli Uberto (Bioinformatics Laboratory, Scientific Institute IRCCS E.Medea) ,  Vertemara Jacopo (Department of Biotechnology and Biosciences, University of Milan-Bicocca) ,  De Gioia Luca (Department of Biotechnology and Biosciences, University of Milan-Bicocca) ,  Clerici Mario (Department of Pathophysiology and Transplantation, University of Milan) ,  Clerici Mario (Don C. Gnocchi Foundation Onlus, IRCCS) ,  Sironi Manuela (Bioinformatics Laboratory, Scientific Institute IRCCS E.Medea)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 854  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： C型肝炎ウイルス(HCV)はHepacウイルス属に属し,遺伝的に不均一であり,7つの主要遺伝子型はさらにいくつかの認識されたサブタイプに分割される。HCV起源は,約200~1000年前に以前に年代決定された。ヒパpacウイルスは,いくつかの国内および野生哺乳類で同定されており,最大のウイルス多様性がコウモリおよびげっ歯類で観察されている。HCVの最も近い親類は,ウマ/ドナキー(ウマのhepacウイルス,EHV)で見つかった。しかし,ヒト病原体としてのHCVの起源はまだ解明されていないパズルである。選択情報進化モデルを用いて,現存するHCV遺伝子型の共通祖先が少なくとも3000年前(CI:3192~5221年前)に存在し,最も古い遺伝子型がアジアに固有であることを示した。EHVは約1100CE(CI:291~1,640CE)に由来した。これらの時間推定は,EHV伝達が主に広範な動物学的実践により維持され,HCVがヒト集団におけるその後の多様化を伴う単一人畜共通イベントに由来することを示唆する。著者らはまた,積極的に選択された主要なHCV遺伝子型における多くの生物学的に重要な部位を記述し,薬剤耐性関連変異体が正に選択された部位において有意に濃縮されていることを示す。HCVは細胞侵入のためにいくつかの細胞表面分子を利用するが,これらのうちの2つ(CD81とOCLN)のみが感染の種特異性を決定する。ここでは,進化分析は霊長類とヒパカウイルス間の長期的な関係を支持せず,CD81における陽性選択のシグナルはキロropにおいてのみ観察された。任意の哺乳類においてOCLNに対する選択の証拠は検出されなかった。これらの結果はHCVの起源に光を当て,HCV表現型多様性の候補遺伝的調節因子のカタログを提供する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： コウモリ ,  *ヒト ,  薬物耐性 ,  種差 ,  遺伝子型 ,  齧歯類 ,  C型肝炎ウイルス ,  霊長類 ,  遺伝 ,  病原体 ,  アジア ,  多様化 ,  遺伝的調節
準シソーラス用語： CD81抗原 ,  パズル , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： C型肝炎ウイルス ,  ウマのヘパシウイルス ,  分子年代測定 ,  TMRCA ,  正の選択 ,  耐性関連アミノ酸変異体 ,  CD81

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 進化 ,  分析 ,  HCV ,  起源 ,  適応 ,  洞察