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J-GLOBAL ID：201802287092060034   整理番号：18A0965901

ノルウェーのロブスター,Nephrops norvegicusのde novoトランスクリプトーム解析後に同定された性および組織特異的遺伝子発現パターン【JST・京大機械翻訳】

Sex and tissue specific gene expression patterns identified following de novo transcriptomic analysis of the Norway lobster, Nephrops norvegicus

著者 (12件)： Rotllant Guiomar (Institut de Ciencies del Mar (CSIC), Barcelona, Spain) ,  Nguyen Tuan Viet (Faculty of Science, Health, Education and Engineering, GeneCology Research Centre, University of the Sunshine Coast, Sunshine Coast, Australia) ,  Sbragaglia Valerio (Institut de Ciencies del Mar (CSIC), Barcelona, Spain) ,  Sbragaglia Valerio (Department of Biology and Ecology of Fishes, Leibniz-Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries, Berlin, Germany) ,  Rahi Lifat (Earth, Environmental and Biological Sciences, Science and Engineering Faculty, Queensland University of Technology, Brisbane, Australia) ,  Dudley Kevin J. (Earth, Environmental and Biological Sciences, Science and Engineering Faculty, Queensland University of Technology, Brisbane, Australia) ,  Hurwood David (Earth, Environmental and Biological Sciences, Science and Engineering Faculty, Queensland University of Technology, Brisbane, Australia) ,  Ventura Tomer (Faculty of Science, Health, Education and Engineering, GeneCology Research Centre, University of the Sunshine Coast, Sunshine Coast, Australia) ,  Company Joan B. (Institut de Ciencies del Mar (CSIC), Barcelona, Spain) ,  Chand Vincent (Earth, Environmental and Biological Sciences, Science and Engineering Faculty, Queensland University of Technology, Brisbane, Australia) ,  Aguzzi Jacopo (Institut de Ciencies del Mar (CSIC), Barcelona, Spain) ,  Mather Peter B. (Earth, Environmental and Biological Sciences, Science and Engineering Faculty, Queensland University of Technology, Brisbane, Australia)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 622  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ノルウェーロブスター,Nephrops norvegicusは,ヨーロッパ漁業において経済的に重要であり,局所海洋生態系における重要な生物である。この種における多面的な科学的関心にもかかわらず,この種における遺伝資源の現在の知識は非常に限られている。ここでは,両性の複数の組織からN.norvegicusに対する参照de novoトランスクリプトームを作成した。生物情報学的分析を行い,雄または雌のいずれかで排他的に発現する転写物を検出した。RT-PCRによりパターンを検証した。【結果】16のN.norvegicusライブラリーを,未成熟および成熟卵巣,精巣および輸精管(雄性腺形成を含む)から配列した。加えて,眼柄,脳,胸神経節および肝膵臓組織を,雄および未成熟および成熟雌においてスクリーニングした。RNA配列決定により,>60百万の読み取りが得られた。現在のデータセットと眼柄組織からの2つの以前に発表されたライブラリーとを組み合わせたde novo集合は,1272bpのN50をもつ708塩基対(bp)の平均サイズを持つ333,225の転写産物の参照トランスクリプトームをもたらした。性特異的転写物は主に生殖腺で検出され,次いで肝膵臓,脳,胸神経節,眼柄が続いた。雄または雌のいずれかで排他的に発現された候補転写物を強調し,10の最も豊富なものをRT-PCRにより検証した。最も高度に発現された遺伝子の中で,精巣におけるセリンスレオニン蛋白質キナーゼと雌性肝膵臓におけるベチロゲニンがあった。これらの結果は遺伝子アノテーション結果と密接に一致した。さらに,差次的発現マップは,差次的に発現された転写物の大部分が生殖腺および眼柄組織で同定されたことを示した。結果は,ノルウェーロブスターにおける性特異的遺伝子発現パターンが,体細胞組織における雄と雌の間の遺伝子調節パターンにおける差異によって制御されることを示す。【結論】本研究は,将来の生物学的,野生の再貯蔵および漁業研究に適用できるノルウェーのロブスターのための最初の多組織参照トランスクリプトームを提示する。性別特異的マーカーは雄で主に発現し,雄が雌より強い選択を経験する可能性があることを意味した。差次的発現は体細胞組織に存在する性特異的遺伝子調節経路によるものであり,ヘテロ配偶子性染色体に位置する遺伝子の影響によるものではないことが明らかである。N.norvegicusデータは将来の遺伝子ベースの生殖研究の基礎を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 精巣 ,  *遺伝子発現 ,  *トランスクリプトーム ,  遺伝的調節 ,  RNA【核酸】 ,  生殖 ,  卵巣 ,  *Homarus ,  *ノルウェー王国 ,  体細胞 ,  *遺伝子 ,  RT-PCR法
準シソーラス用語： 肝膵臓 ,  眼柄 ,  *Nephrops norvegicus , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： ノルウェーのロブスター ,  Nephrops norvegicus ,  遺伝子発現 ,  生殖 ,  RNA-seq ,  性特異的発現 ,  性バイアス発現 ,  トランスクリプトーム

分類 (3件)： 魚類以外の水産動物  (FH02030V) ,  個体群生態学  (EE03030S) ,  動物性水産食品  (FJ13020C)

引用文献 (74件)：

• FAO FishStat. Species Fact Sheets [http://www.fao.org/fishery/statistics/en].
• FAO: State of world fisheries and aquaculture 2012. In. Edited by FAO. Rome; 2012: 209.
• Ventura T, Manor R, Aflalo ED, Weil S, Khalaila I, Rosen O, Sagi A: Expression of an androgenic-gland-specific insulin-like peptide during the course of prawn sexual and morphotypic differentiation. ISRN Endocrinology 2011, vol. 2011:Article ID 476283.
• Macrobrachium rosenbergii Biology of Reproduction; Timing sexual differentiation: full functional sex reversal achieved through silencing of a single insulin-like gene in the prawn; T Ventura, R Manor, ED Aflalo, S Weil, O Rosen, A Sagi; 86; 3; 2012; 90; CR4;
• Mar Biotechnol; A single injection of hypertrophied androgenic gland cells produces all-female aquaculture; T Levy, O Rosen, B Eilam, D Azulay, ED Aflalo, R Manor, A Shechter, A Sagi; 18; 5; 2016; 554-563; 10.1007/s10126-016-9717-5; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： ノルウェー ,  ロブスター ,  トランスクリプトーム解析 ,  同定 ,  性 ,  組織 ,  遺伝子発現パターン