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J-GLOBAL ID：201802287209593308   整理番号：18A1646410

アルゼンチンの登録集団のHLA遺伝子構造は,多様な人口統計学的歴史を反映する【JST・京大機械翻訳】

P083 The HLA genetic structure of an argentinian registry population reflect a divergent demographic history

著者 (9件)： Creary Lisa E. (Stanford University School of Medicine, Department of Pathology, Palo Alto, CA, United States) ,  Galarza Pablo (Registro Nacional De Donantes De Celulas Progenitoras Hematopoyeticas, Instituto Nacional Central Unico Coordinator de Ablacion e Implante (INCUCAI), Buenos Aires, Argentina) ,  Chang Chia-Jung (Stanford Genome Technology Center, Palo Alto, CA, United States) ,  Shields Brian (Laboratory Corporation of America (LabCorp), Burlington, NC, United States) ,  Maha George C. (Laboratory Corporation of America (LabCorp), Burlington, NC, United States) ,  Cardozo M. Belen Rodriguez (Registro Nacional De Donantes De Celulas Progenitoras Hematopoyeticas, Instituto Nacional Central Unico Coordinator de Ablacion e Implante (INCUCAI), Buenos Aires, Argentina) ,  Osoegawa Kazutoyo (Stanford Blood Center, Histocompatibility, Immunogenetics and Disease Profiling Laboratory, Palo Alto, CA, United States) ,  Vayntrub Tamara A. (Stanford Blood Center, Histocompatibility, Immunogenetics and Disease Profiling Laboratory, Palo Alto, CA, United States) ,  Fernandez-Vina Marcelo A. (Stanford University School of Medicine, Department of Pathology, Palo Alto, CA, United States)
資料名： Human Immunology  (Human Immunology)
巻： 79  号： S  ページ： 122  発行年： 2018年 
JST資料番号： E0289B  ISSN： 0198-8859  CODEN： HUIMDQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アルゼンチンは,ヨーロッパ,固有のアメリカ人,メスチゾス,および非ヨーロッパの子孫のアマルガム化を代表するが,各民族グループからの寄与は,遺伝的観点から比較的未探求のままである。著者らは,INCUCAI-アルゼンチン非血縁ドナーBMT登録からの大規模収集におけるHLA対立遺伝子とハプロタイプ頻度の分布を決定するためにNGSを適用した。コホートは,70の民族グループからの祖先を持つ個人(>36000)から構成されている。分析を容易にするために,個人を10の広い民族グループに分類した。イベリア,混合-ヒスパニック,地中海,中央/西欧,東ヨーロッパ,英語,フランス,中東,API,および他は,報告されていないまたはアフリカの祖先を持つ個人に関連している。個体群内多様性の種々のパラメータを,ヘテロ接合性,LD,および選択的中立性を含めて評価した。ハプロタイプ頻度をEMアルゴリズムを用いて推定した。個体群間分散を,系統樹を構築するために用いたFst距離を用いて決定した。クラスI遺伝子座における最も頻度の高い対立遺伝子は,a*02:01:01G;C*04:01:01G;9群におけるB*51:01:01G,B*07:01:01GおよびB*18:01:01Gは,東ヨーロッパ人および英語人において最も一般的であった。DQB1*02:01:01GとDQB1*03:01:01G,DRB1*07:01:01Gは,すべての群を通して頻繁であった。HLA-B遺伝子座において,混合ヒスパニックはより大きな多様性(178対立遺伝子)を示し,最も低い多様性はフランス(51対立遺伝子)で観察された。Native-Americanの祖先は,Iberiansにおいて20%の最も高い表現型頻度を持つB*15,B*35,B*39,B*40,B*48,B*51,B*52希少対立遺伝子の存在により示された。明確なHLA関連性を有するハプロタイプが一般的であり,特定の民族群に特異的であった。遺伝的距離はアルゼンチン個体群がヨーロッパ個体群と強いHLA親和性を共有することを示した。アルゼンチンの住民における発散性HLAシグネチャは,ヨーロッパ人の新しい世界への異なる移動イベントに言及している。著者らのデータはアルゼンチン登録の明確なHLAプロファイルを提供し,この情報はBMT患者に対するドナー選択の精度を増加させるのに有用である可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 母集団 ,  ハプロタイプ ,  対立遺伝子 ,  患者 ,  住民 ,  *遺伝 ,  ヨーロッパ ,  個体群 ,  *アルゼンチン共和国 ,  民族 ,  系統樹 ,  東ヨーロッパ ,  アフリカ ,  フランス共和国 ,  表現型

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： アルゼンチン ,  集団 ,  HLA遺伝子 ,  人口統計学 ,  歴史