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J-GLOBAL ID：201802287373402169   整理番号：18A0793143

暗黒プロテオームのモデリングの一般化Born溶媒記述におけるヘリックス傾向について【JST・京大機械翻訳】

On the Helix Propensity in Generalized Born Solvent Descriptions of Modeling the Dark Proteome

著者 (1件)： Olson Mark A. (Department of Cell Biology and Biochemistry, Molecular and Translational Sciences Division, United States Army Medical Research Institute for Infectious Diseases)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 4  ページ： 3  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： いわゆる「Dark Proteome」を普及させる本質的に無秩序な蛋白質は,多次元エネルギー景観における立体配座転移を正確にモデル化するための原子論的シミュレーション法の挑戦的なベンチマークを提供する。本研究では,Ebolaウイルス蛋白質VP35から誘導された本質的に無秩序なペプチドの立体配座集合を捉えるための計算フレームワークとして,陰的溶媒モデルを用いた並列テンパリングの応用を調べた。最近のX線結晶学的研究により,VP35ペプチドがEbola蛋白質NPとの分子会合により折畳み転移を起こし,ペプチドの無秩序傾向及び連続溶媒中の状態密度を計算し,全原子分解能における水相互作用のモデル化の効果を調べた。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  ベンチマーク ,  計算 ,  状態密度 ,  *モデリング ,  ペプチド ,  立体配座 ,  配座転移 ,  *プロテオーム ,  X線結晶学 ,  高次元
準シソーラス用語： 原子分解能 ,  テンパリング ,  エボラウイルス ,  原子論的シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 分子動力学 ,  自由エネルギー景観 ,  内在性無秩序蛋白質 ,  陽/陰溶媒モデルレプリカ交換シミュレーション

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： プロテオーム ,  モデリング ,  一般化 ,  溶媒 ,  記述 ,  ヘリックス ,  傾向