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J-GLOBAL ID：201802287644353324   整理番号：18A0717199

化合物スクリーンからの遺伝子相互作用のゲノム規模の特徴は標的化癌治療の臨床効果を予測する【JST・京大機械翻訳】

Genome-Scale Signatures of Gene Interaction from Compound Screens Predict Clinical Efficacy of Targeted Cancer Therapies

著者 (12件)： Jiang Peng (Department of Biostatistics and Computational Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard T.H. Chan School of Public Health, Boston, MA 02215, USA) ,  Lee Winston (Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital, Boston, MA 02115, USA) ,  Li Xujuan (School of Life Science and Technology, Tongji University, Shanghai 200092, China) ,  Johnson Carl (Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital, Boston, MA 02115, USA) ,  Liu Jun S. (Department of Statistics, Harvard University, Cambridge, MA 02138, USA) ,  Brown Myles (Department of Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute and Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Brown Myles (Center for Functional Cancer Epigenetics, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, MA 02115, USA) ,  Aster Jon Christopher (Department of Pathology, Brigham and Women’s Hospital, Boston, MA 02115, USA) ,  Liu X. Shirley (Department of Biostatistics and Computational Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard T.H. Chan School of Public Health, Boston, MA 02215, USA) ,  Liu X. Shirley (School of Life Science and Technology, Tongji University, Shanghai 200092, China) ,  Liu X. Shirley (Department of Statistics, Harvard University, Cambridge, MA 02138, USA) ,  Liu X. Shirley (Center for Functional Cancer Epigenetics, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, MA 02115, USA)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 6  号： 3  ページ： 343-354.e5  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 信頼できる薬物応答バイオマーカーの同定は癌研究における重要な課題である。著者らは,細胞系化合物スクリーンからの薬物有効性のゲノム全体のトランスクリプトームの特徴を推論するために,標的治療に焦点を合わせた計算法である耐性(CARE)の計算解析を提示する。薬物標的遺伝子が他の遺伝子と相互作用して,化合物スクリーンにおける阻害剤有効性に影響するかどうかを測定するために,ケアはゲノムスケールスコアを出力する。薬物標的と他の遺伝子の間のそのような統計的相互作用は以前の研究では考慮されていなかったが,予測バイオマーカーの同定において重要である。臨床研究からトランスクリプトームデータを用いて評価すると,CAREは他の計算法やゲノミクス実験からの特徴よりも治療成績をより良く予測できる。さらに,PLX4720BRAF阻害剤に対するCAREシグネチャは,抗プログラム死1臨床応答と関連し,標的治療と免疫療法の間の共通の有効性を示唆する。lapチニブ耐性に関連する遺伝子を検索すると,CAREはPRKD3をトップ候補として同定した。PRKD3阻害は,低分子干渉RNAと化合物の両方により,乳癌細胞をラプラチニブに有意に感作した。したがって,CAREは,化合物スクリーンデータを用いた標的治療のための応答バイオマーカーと薬物の組み合わせの大規模な推論を可能にするはずである。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *予測 ,  トランスクリプトーム ,  *相互作用 ,  siRNA ,  *ターゲティング ,  バイオマーカー ,  免疫療法 ,  *ゲノム ,  分子標的療法 ,  *スクリーン
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  阻害剤 ,  創薬標的 ,  *癌治療 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 遺伝子相互作用 ,  薬剤耐性 ,  標的治療 ,  免疫療法 ,  複合スクリーン ,  応答バイオマーカー

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (8件)： スクリーン ,  遺伝子相互作用 ,  ゲノム ,  規模 ,  標的化 ,  癌治療 ,  臨床効果 ,  予測